Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
R3HDM1Q15032 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
R3HDM1Q15032 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
R3HDM1Q15032 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
R3HDM1Q15032 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
R3HDM1Q15032 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
R3HDM1Q15032 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
R3HDM1Q15032 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
R3HDM1Q15032 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
R3HDM1Q15032 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
R3HDM1Q15032 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
R3HDM1Q15032 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
R3HDM1Q15032 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
R3HDM1Q15032 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
R3HDM1Q15032 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
R3HDM1Q15032 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
R3HDM1Q15032 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
R3HDM1Q15032 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
R3HDM1Q15032 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
R3HDM1Q15032 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
R3HDM1Q15032 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
R3HDM1Q15032 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
R3HDM1Q15032 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
R3HDM1Q15032 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
R3HDM1Q15032 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
R3HDM1Q15032 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
R3HDM1Q15032 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
R3HDM1Q15032 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
R3HDM1Q15032 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
R3HDM1Q15032 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
R3HDM1Q15032 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
R3HDM1Q15032 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
R3HDM1Q15032 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
R3HDM1Q15032 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
R3HDM1Q15032 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
R3HDM1Q15032 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
R3HDM1Q15032 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
R3HDM1Q15032 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
R3HDM1Q15032 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
R3HDM1Q15032 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
R3HDM1Q15032 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
R3HDM1Q15032 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
R3HDM1Q15032 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
R3HDM1Q15032 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
R3HDM1Q15032 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
R3HDM1Q15032 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
R3HDM1Q15032 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
R3HDM1Q15032 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
R3HDM1Q15032 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
R3HDM1Q15032 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
R3HDM1Q15032 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
R3HDM1Q15032 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
R3HDM1Q15032 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.76■■■□□ 2.99
R3HDM1Q15032 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
R3HDM1Q15032 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
R3HDM1Q15032 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
R3HDM1Q15032 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
R3HDM1Q15032 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
R3HDM1Q15032 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
R3HDM1Q15032 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
R3HDM1Q15032 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
R3HDM1Q15032 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
R3HDM1Q15032 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
R3HDM1Q15032 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
R3HDM1Q15032 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
R3HDM1Q15032 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
R3HDM1Q15032 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
R3HDM1Q15032 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
R3HDM1Q15032 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
R3HDM1Q15032 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
R3HDM1Q15032 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
R3HDM1Q15032 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
R3HDM1Q15032 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
R3HDM1Q15032 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
R3HDM1Q15032 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
R3HDM1Q15032 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
R3HDM1Q15032 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
R3HDM1Q15032 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
R3HDM1Q15032 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
R3HDM1Q15032 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
R3HDM1Q15032 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
R3HDM1Q15032 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
R3HDM1Q15032 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
R3HDM1Q15032 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
R3HDM1Q15032 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
R3HDM1Q15032 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
R3HDM1Q15032 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
R3HDM1Q15032 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
R3HDM1Q15032 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
R3HDM1Q15032 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
R3HDM1Q15032 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
R3HDM1Q15032 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
R3HDM1Q15032 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
R3HDM1Q15032 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
R3HDM1Q15032 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
R3HDM1Q15032 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
R3HDM1Q15032 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
R3HDM1Q15032 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
R3HDM1Q15032 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
R3HDM1Q15032 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms