Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 CENPF-202ENST00000464322 689 ntTSL 213.13□□□□□ -0.318e-7■■■■■ 66.2
EFTUD2Q15029 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.728e-7■■■■■ 66.2
EFTUD2Q15029 CPNE1-214ENST00000435747 400 ntTSL 39.59□□□□□ -0.874e-27■■■■■ 66
EFTUD2Q15029 VIM-203ENST00000469543 2666 ntTSL 220.08■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 65.9
EFTUD2Q15029 VIM-206ENST00000487938 2272 ntTSL 518.88■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 65.9
EFTUD2Q15029 VIM-209ENST00000544301 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)18.82■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 65.9
EFTUD2Q15029 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 65.9
EFTUD2Q15029 SCAMP4-210ENST00000588555 1785 nt26.32■■□□□ 1.87e-15■■■■■ 65.8
EFTUD2Q15029 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.637e-15■■■■■ 65.8
EFTUD2Q15029 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.467e-12■■■■■ 65.8
EFTUD2Q15029 SCAMP4-204ENST00000414057 1477 ntTSL 1 (best)16.7■□□□□ 0.267e-12■■■■■ 65.8
EFTUD2Q15029 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.137e-12■■■■■ 65.8
EFTUD2Q15029 SCAMP4-205ENST00000452128 718 ntTSL 215.37■□□□□ 0.057e-12■■■■■ 65.8
EFTUD2Q15029 SCAMP4-206ENST00000460767 569 ntTSL 413.01□□□□□ -0.337e-12■■■■■ 65.8
EFTUD2Q15029 SCAMP4-208ENST00000489554 573 ntTSL 310.39□□□□□ -0.757e-12■■■■■ 65.8
EFTUD2Q15029 HIRIP3-203ENST00000563680 755 ntTSL 322.29■■□□□ 1.165e-8■■■■■ 65.8
EFTUD2Q15029 HIRIP3-202ENST00000563053 1686 ntTSL 215.92■□□□□ 0.145e-8■■■■■ 65.8
EFTUD2Q15029 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.075e-8■■■■■ 65.8
EFTUD2Q15029 HIRIP3-201ENST00000279392 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.425e-8■■■■■ 65.8
EFTUD2Q15029 RPL3-214ENST00000473638 523 ntTSL 217.24■□□□□ 0.351e-8■■■■■ 65.7
EFTUD2Q15029 RPL3-210ENST00000464182 616 ntTSL 213.59□□□□□ -0.231e-8■■■■■ 65.7
EFTUD2Q15029 ID3-202ENST00000463312 623 ntTSL 210.96□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 65.4
EFTUD2Q15029 SLC3A2-217ENST00000541425 595 ntTSL 510.61□□□□□ -0.719e-18■■■■■ 65.4
EFTUD2Q15029 HNRNPH1-226ENST00000515446 368 ntTSL 214.92□□□□□ -0.023e-50■■■■■ 65.3
EFTUD2Q15029 ATXN7L3-203ENST00000586688 468 ntTSL 27.5□□□□□ -1.215e-13■■■■■ 65.3
EFTUD2Q15029 RIPOR1-215ENST00000566730 634 ntTSL 416.61■□□□□ 0.252e-11■■■■■ 65.3
EFTUD2Q15029 RIPOR1-220ENST00000569179 418 ntTSL 510.48□□□□□ -0.732e-11■■■■■ 65.3
EFTUD2Q15029 PANK4-204ENST00000471361 722 ntTSL 216.86■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 65.2
EFTUD2Q15029 ACCS-208ENST00000531505 913 ntTSL 314.38□□□□□ -0.112e-8■■■■■ 65.1
EFTUD2Q15029 ACCS-213ENST00000534035 532 ntTSL 313.14□□□□□ -0.312e-8■■■■■ 65.1
EFTUD2Q15029 ACCS-201ENST00000263776 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.372e-8■■■■■ 65.1
EFTUD2Q15029 ACCS-207ENST00000531190 639 ntTSL 310.32□□□□□ -0.762e-8■■■■■ 65.1
EFTUD2Q15029 ACCS-205ENST00000527557 397 ntTSL 310.23□□□□□ -0.772e-8■■■■■ 65.1
EFTUD2Q15029 ACCS-204ENST00000527346 3373 ntTSL 29.04□□□□□ -0.962e-8■■■■■ 65.1
EFTUD2Q15029 ACCS-210ENST00000532122 527 ntTSL 38.46□□□□□ -1.062e-8■■■■■ 65.1
EFTUD2Q15029 MCM7-206ENST00000465688 481 ntTSL 316.96■□□□□ 0.313e-8■■■■■ 65.1
EFTUD2Q15029 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.883e-22■■■■■ 65.1
EFTUD2Q15029 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.813e-22■■■■■ 65.1
EFTUD2Q15029 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.473e-22■■■■■ 65.1
EFTUD2Q15029 RTCA-204ENST00000483474 683 ntTSL 316.43■□□□□ 0.223e-22■■■■■ 65.1
EFTUD2Q15029 RTCA-205ENST00000498617 731 ntTSL 516.43■□□□□ 0.223e-22■■■■■ 65.1
EFTUD2Q15029 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.033e-9■■■■■ 65
EFTUD2Q15029 ADD1-222ENST00000536424 594 ntTSL 514.47□□□□□ -0.093e-9■■■■■ 65
EFTUD2Q15029 ADD1-206ENST00000398129 3787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.543e-9■■■■■ 65
EFTUD2Q15029 ADD1-219ENST00000514940 1332 ntTSL 511.67□□□□□ -0.543e-9■■■■■ 65
EFTUD2Q15029 ADD1-218ENST00000513762 3581 ntTSL 310.8□□□□□ -0.683e-9■■■■■ 65
EFTUD2Q15029 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.247e-8■■■■■ 64.8
EFTUD2Q15029 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.987e-8■■■■■ 64.8
EFTUD2Q15029 C7orf26-204ENST00000445375 675 ntTSL 518.14■□□□□ 0.497e-8■■■■■ 64.8
EFTUD2Q15029 C7orf26-203ENST00000440409 458 ntTSL 315.16■□□□□ 0.027e-8■■■■■ 64.8
EFTUD2Q15029 C7orf26-206ENST00000477298 542 ntTSL 313.57□□□□□ -0.243e-8■■■■■ 64.8
EFTUD2Q15029 C7orf26-205ENST00000472693 1006 ntTSL 513.12□□□□□ -0.317e-8■■■■■ 64.8
EFTUD2Q15029 NPM3-204ENST00000474993 755 ntTSL 220.3■□□□□ 0.848e-10■■■■■ 64.8
EFTUD2Q15029 NPM3-202ENST00000462391 481 ntTSL 320.02■□□□□ 0.88e-10■■■■■ 64.8
EFTUD2Q15029 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.538e-10■■■■■ 64.8
EFTUD2Q15029 ARFGAP1-216ENST00000522959 556 ntTSL 214.62□□□□□ -0.075e-8■■■■■ 64.8
EFTUD2Q15029 SKIV2L-213ENST00000491994 866 ntTSL 214.37□□□□□ -0.112e-45■■■■■ 64.7
EFTUD2Q15029 CYC1-203ENST00000528618 831 ntTSL 517.8■□□□□ 0.442e-26■■■■■ 64.5
EFTUD2Q15029 PLCG1-213ENST00000599785 880 ntTSL 58.38□□□□□ -1.073e-8■■■■■ 64.5
EFTUD2Q15029 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.112e-7■■■■■ 64.3
EFTUD2Q15029 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.012e-7■■■■■ 64.3
EFTUD2Q15029 HES6-207ENST00000417803 474 ntTSL 320.99■□□□□ 0.952e-7■■■■■ 64.3
EFTUD2Q15029 TSPAN9-204ENST00000444315 570 ntTSL 415.91■□□□□ 0.141e-11■■■■■ 64.2
EFTUD2Q15029 TSPAN9-207ENST00000539631 584 ntTSL 312.41□□□□□ -0.421e-11■■■■■ 64.2
EFTUD2Q15029 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.292e-15■■■■■ 64.1
EFTUD2Q15029 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.722e-15■■■■■ 64.1
EFTUD2Q15029 RPL8-203ENST00000525232 1007 ntTSL 1 (best)19.37■□□□□ 0.695e-12■■■■■ 64.1
EFTUD2Q15029 HIP1R-202ENST00000452196 2054 ntTSL 1 (best)19.13■□□□□ 0.653e-12■■■■■ 63.9
EFTUD2Q15029 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.353e-12■■■■■ 63.9
EFTUD2Q15029 HIP1R-204ENST00000535831 3078 ntTSL 216.51■□□□□ 0.233e-12■■■■■ 63.9
EFTUD2Q15029 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.231e-15■■■■■ 63.9
EFTUD2Q15029 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.231e-15■■■■■ 63.9
EFTUD2Q15029 AMBRA1-212ENST00000534300 5067 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.363e-12■■■■■ 63.9
EFTUD2Q15029 AMBRA1-201ENST00000314845 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.43e-12■■■■■ 63.9
EFTUD2Q15029 HIP1R-206ENST00000536772 538 ntTSL 212.57□□□□□ -0.41e-13■■■■■ 63.9
EFTUD2Q15029 AMBRA1-210ENST00000531542 561 ntTSL 312.43□□□□□ -0.423e-12■■■■■ 63.9
EFTUD2Q15029 AMBRA1-211ENST00000533727 4817 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.563e-12■■■■■ 63.9
EFTUD2Q15029 AMBRA1-202ENST00000458649 5351 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.643e-12■■■■■ 63.9
EFTUD2Q15029 SAT1-208ENST00000487713 432 ntTSL 29.93□□□□□ -0.825e-19■■■■■ 63.9
EFTUD2Q15029 AMBRA1-206ENST00000528950 4102 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.953e-12■■■■■ 63.9
EFTUD2Q15029 NELFCD-210ENST00000490205 650 ntTSL 22.86□□□□□ -1.953e-12■■■■■ 63.9
EFTUD2Q15029 RPS2-217ENST00000563194 170 ntTSL 52.66□□□□□ -1.983e-15■■■■■ 63.9
EFTUD2Q15029 RPS11-206ENST00000600027 944 ntTSL 511.93□□□□□ -0.59e-12■■■■■ 63.6
EFTUD2Q15029 RPS11-204ENST00000599167 1133 ntTSL 511.93□□□□□ -0.59e-12■■■■■ 63.6
EFTUD2Q15029 RPS11-201ENST00000270625 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.019e-12■■■■■ 63.6
EFTUD2Q15029 RPS11-202ENST00000594493 575 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.079e-12■■■■■ 63.6
EFTUD2Q15029 RPS11-209ENST00000602252 751 ntTSL 28.34□□□□□ -1.079e-12■■■■■ 63.6
EFTUD2Q15029 RPS11-208ENST00000601306 547 ntTSL 37.79□□□□□ -1.169e-12■■■■■ 63.6
EFTUD2Q15029 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.219e-12■■■■■ 63.6
EFTUD2Q15029 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.399e-12■■■■■ 63.6
EFTUD2Q15029 PELP1-207ENST00000571347 708 ntTSL 219.44■□□□□ 0.75e-7■■■■■ 63.5
EFTUD2Q15029 KCTD9-205ENST00000519665 2128 ntTSL 519.13■□□□□ 0.659e-12■■■■■ 63.4
EFTUD2Q15029 KCTD9-207ENST00000521458 541 ntTSL 218.25■□□□□ 0.519e-12■■■■■ 63.4
EFTUD2Q15029 KCTD9-208ENST00000522493 530 ntTSL 417.71■□□□□ 0.439e-12■■■■■ 63.4
EFTUD2Q15029 KCTD9-204ENST00000518997 679 ntTSL 317.71■□□□□ 0.439e-12■■■■■ 63.4
EFTUD2Q15029 KCTD9-203ENST00000518067 849 ntTSL 517.27■□□□□ 0.369e-12■■■■■ 63.4
EFTUD2Q15029 KCTD9-209ENST00000523140 840 ntTSL 316.36■□□□□ 0.219e-12■■■■■ 63.4
EFTUD2Q15029 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.099e-12■■■■■ 63.4
EFTUD2Q15029 KCTD9-211ENST00000524217 400 ntTSL 214.09□□□□□ -0.159e-12■■■■■ 63.4
EFTUD2Q15029 TNFRSF1A-210ENST00000537842 404 ntTSL 32.4□□□□□ -2.035e-7■■■■■ 63.3
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