RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536424.2

ADD1-222, Transcript of adducin 1, humanhuman

TSL 5

Gene ADD1, Length 594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADD1-222ENST00000536424 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.11■■■■□ 3.85
ADD1-222ENST00000536424 ABCC9O60706 1549 aa35.75■■■■□ 3.31
ADD1-222ENST00000536424 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.21■■■■□ 3.23
ADD1-222ENST00000536424 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.88■■■■□ 3.01
ADD1-222ENST00000536424 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.77■■■■□ 3
ADD1-222ENST00000536424 NACADO15069 1562 aa33.43■■■□□ 2.94
ADD1-222ENST00000536424 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.38■■■□□ 2.93
ADD1-222ENST00000536424 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.26■■■□□ 2.91
ADD1-222ENST00000536424 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.98■■■□□ 2.87
ADD1-222ENST00000536424 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.79■■■□□ 2.84
ADD1-222ENST00000536424 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.77■■■□□ 2.84
ADD1-222ENST00000536424 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
ADD1-222ENST00000536424 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.24■■■□□ 2.75
ADD1-222ENST00000536424 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.22■■■□□ 2.75
ADD1-222ENST00000536424 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.22■■■□□ 2.75
ADD1-222ENST00000536424 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.21■■■□□ 2.75
ADD1-222ENST00000536424 SCRIBQ14160 1630 aa32.17■■■□□ 2.74
ADD1-222ENST00000536424 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
ADD1-222ENST00000536424 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.39■■■□□ 2.62
ADD1-222ENST00000536424 ERCC6Q03468 1493 aa30.9■■■□□ 2.54
ADD1-222ENST00000536424 CUX2O14529 1486 aa30.89■■■□□ 2.54
ADD1-222ENST00000536424 NCAPD3P42695 1498 aa30.87■■■□□ 2.53
ADD1-222ENST00000536424 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.74■■■□□ 2.51
ADD1-222ENST00000536424 SMARCA2P51531 1590 aa30.62■■■□□ 2.49
ADD1-222ENST00000536424 SMARCA4P51532 1647 aa30.59■■■□□ 2.49
ADD1-222ENST00000536424 HMGXB3Q12766 1538 aa30.58■■■□□ 2.49
ADD1-222ENST00000536424 NESP48681 1621 aa30.58■■■□□ 2.49
ADD1-222ENST00000536424 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
ADD1-222ENST00000536424 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
ADD1-222ENST00000536424 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
ADD1-222ENST00000536424 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.24■■■□□ 2.43
ADD1-222ENST00000536424 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.24■■■□□ 2.43
ADD1-222ENST00000536424 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.15■■■□□ 2.42
ADD1-222ENST00000536424 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.13■■■□□ 2.41
ADD1-222ENST00000536424 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.12■■■□□ 2.41
ADD1-222ENST00000536424 TRIM41Q8WV44 630 aa29.96■■■□□ 2.39
ADD1-222ENST00000536424 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.94■■■□□ 2.38
ADD1-222ENST00000536424 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.87■■■□□ 2.37
ADD1-222ENST00000536424 WIZO95785 1651 aa29.79■■■□□ 2.36
ADD1-222ENST00000536424 WDR62O43379 1518 aa29.77■■■□□ 2.36
ADD1-222ENST00000536424 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.69■■■□□ 2.34
ADD1-222ENST00000536424 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.62■■■□□ 2.33
ADD1-222ENST00000536424 OSCARQ8IYS5 282 aa29.5■■■□□ 2.31
ADD1-222ENST00000536424 CFTRP13569 1480 aa29.49■■■□□ 2.31
ADD1-222ENST00000536424 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
ADD1-222ENST00000536424 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
ADD1-222ENST00000536424 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
ADD1-222ENST00000536424 PRDM2Q13029 1718 aa29.12■■■□□ 2.25
ADD1-222ENST00000536424 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
ADD1-222ENST00000536424 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.11■■■□□ 2.25
ADD1-222ENST00000536424 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.11■■■□□ 2.25
ADD1-222ENST00000536424 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.11■■■□□ 2.25
ADD1-222ENST00000536424 IFT140Q96RY7 1462 aa29.09■■■□□ 2.25
ADD1-222ENST00000536424 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.05■■■□□ 2.24
ADD1-222ENST00000536424 TOPBP1Q92547 1522 aa29■■■□□ 2.23
ADD1-222ENST00000536424 ARHGEF11O15085 1522 aa28.99■■■□□ 2.23
ADD1-222ENST00000536424 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
ADD1-222ENST00000536424 ABCC8Q09428 1581 aa28.88■■■□□ 2.21
ADD1-222ENST00000536424 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.88■■■□□ 2.21
ADD1-222ENST00000536424 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.84■■■□□ 2.21
ADD1-222ENST00000536424 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.81■■■□□ 2.21e-6■■■□□ 18.6
ADD1-222ENST00000536424 FBLN2P98095 1184 aa28.8■■■□□ 2.2
ADD1-222ENST00000536424 CHD1O14646 1710 aa28.77■■■□□ 2.2
ADD1-222ENST00000536424 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
ADD1-222ENST00000536424 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
ADD1-222ENST00000536424 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
ADD1-222ENST00000536424 ARAP1Q96P48 1450 aa28.67■■■□□ 2.18
ADD1-222ENST00000536424 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.62■■■□□ 2.17
ADD1-222ENST00000536424 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
ADD1-222ENST00000536424 SOGA1O94964 1423 aa28.58■■■□□ 2.17
ADD1-222ENST00000536424 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.5■■■□□ 2.15
ADD1-222ENST00000536424 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
ADD1-222ENST00000536424 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.46■■■□□ 2.15
ADD1-222ENST00000536424 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.4■■■□□ 2.14
ADD1-222ENST00000536424 SYNJ1O43426 1573 aa28.38■■■□□ 2.13
ADD1-222ENST00000536424 WDR97A6NE52 1622 aa28.37■■■□□ 2.13
ADD1-222ENST00000536424 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
ADD1-222ENST00000536424 CUX1P39880 1505 aa28.36■■■□□ 2.13
ADD1-222ENST00000536424 GRIN2BQ13224 1484 aa28.34■■■□□ 2.13
ADD1-222ENST00000536424 SYNJ2O15056 1496 aa28.29■■■□□ 2.12
ADD1-222ENST00000536424 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.21■■■□□ 2.11
ADD1-222ENST00000536424 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
ADD1-222ENST00000536424 PBRM1Q86U86 1689 aa28.19■■■□□ 2.1
ADD1-222ENST00000536424 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.08■■■□□ 2.08
ADD1-222ENST00000536424 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.06■■■□□ 2.08
ADD1-222ENST00000536424 GRIN2AQ12879 1464 aa27.98■■■□□ 2.07
ADD1-222ENST00000536424 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.98■■■□□ 2.07
ADD1-222ENST00000536424 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
ADD1-222ENST00000536424 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.92■■■□□ 2.06
ADD1-222ENST00000536424 ADAMTS12P58397 1594 aa27.89■■■□□ 2.05
ADD1-222ENST00000536424 CEP170Q5SW79 1584 aa27.89■■■□□ 2.05
ADD1-222ENST00000536424 NUP160Q12769 1436 aa27.87■■■□□ 2.05
ADD1-222ENST00000536424 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.82■■■□□ 2.04
ADD1-222ENST00000536424 SHROOM2Q13796 1616 aa27.78■■■□□ 2.04
ADD1-222ENST00000536424 TOP2BQ02880 1626 aa27.77■■■□□ 2.04
ADD1-222ENST00000536424 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.75■■■□□ 2.03
ADD1-222ENST00000536424 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
ADD1-222ENST00000536424 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.71■■■□□ 2.03
ADD1-222ENST00000536424 JPH4Q96JJ6 628 aa27.67■■■□□ 2.02
ADD1-222ENST00000536424 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms