RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464322.5

CENPF-202, Transcript of centromere protein F, humanhuman

TSL 2

Gene CENPF, Length 689 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-202ENST00000464322 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.89■■■■□ 3.34
CENPF-202ENST00000464322 ABCC9O60706 1549 aa32.91■■■□□ 2.86
CENPF-202ENST00000464322 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.26■■■□□ 2.75
CENPF-202ENST00000464322 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.25■■■□□ 2.59
CENPF-202ENST00000464322 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.03■■■□□ 2.56
CENPF-202ENST00000464322 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.86■■■□□ 2.53
CENPF-202ENST00000464322 NACADO15069 1562 aa30.7■■■□□ 2.5
CENPF-202ENST00000464322 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.68■■■□□ 2.5
CENPF-202ENST00000464322 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.17■■■□□ 2.42
CENPF-202ENST00000464322 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.06■■■□□ 2.4
CENPF-202ENST00000464322 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.06■■■□□ 2.4
CENPF-202ENST00000464322 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
CENPF-202ENST00000464322 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.67■■■□□ 2.34
CENPF-202ENST00000464322 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
CENPF-202ENST00000464322 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.6■■■□□ 2.33
CENPF-202ENST00000464322 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.6■■■□□ 2.33
CENPF-202ENST00000464322 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.53■■■□□ 2.32
CENPF-202ENST00000464322 SCRIBQ14160 1630 aa29.52■■■□□ 2.32
CENPF-202ENST00000464322 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
CENPF-202ENST00000464322 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.24■■■□□ 2.27
CENPF-202ENST00000464322 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.02■■■□□ 2.24
CENPF-202ENST00000464322 ERCC6Q03468 1493 aa28.49■■■□□ 2.15
CENPF-202ENST00000464322 CUX2O14529 1486 aa28.44■■■□□ 2.14
CENPF-202ENST00000464322 NCAPD3P42695 1498 aa28.38■■■□□ 2.13
CENPF-202ENST00000464322 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.25■■■□□ 2.11
CENPF-202ENST00000464322 SMARCA2P51531 1590 aa28.13■■■□□ 2.09
CENPF-202ENST00000464322 NESP48681 1621 aa28.1■■■□□ 2.09
CENPF-202ENST00000464322 HMGXB3Q12766 1538 aa28.06■■■□□ 2.08
CENPF-202ENST00000464322 SMARCA4P51532 1647 aa28.05■■■□□ 2.08
CENPF-202ENST00000464322 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
CENPF-202ENST00000464322 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
CENPF-202ENST00000464322 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
CENPF-202ENST00000464322 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.76■■■□□ 2.03
CENPF-202ENST00000464322 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.75■■■□□ 2.03
CENPF-202ENST00000464322 TRIM41Q8WV44 630 aa27.72■■■□□ 2.03
CENPF-202ENST00000464322 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.7■■■□□ 2.03
CENPF-202ENST00000464322 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.67■■■□□ 2.02
CENPF-202ENST00000464322 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.61■■■□□ 2.01
CENPF-202ENST00000464322 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.57■■■□□ 2
CENPF-202ENST00000464322 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.46■■□□□ 1.99
CENPF-202ENST00000464322 WDR62O43379 1518 aa27.33■■□□□ 1.97
CENPF-202ENST00000464322 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.29■■□□□ 1.96
CENPF-202ENST00000464322 WIZO95785 1651 aa27.29■■□□□ 1.96
CENPF-202ENST00000464322 OSCARQ8IYS5 282 aa27.26■■□□□ 1.95
CENPF-202ENST00000464322 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.23■■□□□ 1.95
CENPF-202ENST00000464322 CFTRP13569 1480 aa27.09■■□□□ 1.93
CENPF-202ENST00000464322 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
CENPF-202ENST00000464322 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
CENPF-202ENST00000464322 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
CENPF-202ENST00000464322 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
CENPF-202ENST00000464322 IFT140Q96RY7 1462 aa26.75■■□□□ 1.87
CENPF-202ENST00000464322 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.75■■□□□ 1.87
CENPF-202ENST00000464322 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.75■■□□□ 1.87
CENPF-202ENST00000464322 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.75■■□□□ 1.87
CENPF-202ENST00000464322 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.7■■□□□ 1.86
CENPF-202ENST00000464322 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.68■■□□□ 1.86
CENPF-202ENST00000464322 ARHGEF11O15085 1522 aa26.65■■□□□ 1.86
CENPF-202ENST00000464322 TOPBP1Q92547 1522 aa26.65■■□□□ 1.86
CENPF-202ENST00000464322 FBLN2P98095 1184 aa26.62■■□□□ 1.85
CENPF-202ENST00000464322 PRDM2Q13029 1718 aa26.62■■□□□ 1.85
CENPF-202ENST00000464322 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
CENPF-202ENST00000464322 ABCC8Q09428 1581 aa26.57■■□□□ 1.84
CENPF-202ENST00000464322 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
CENPF-202ENST00000464322 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
CENPF-202ENST00000464322 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.46■■□□□ 1.83
CENPF-202ENST00000464322 CHD1O14646 1710 aa26.37■■□□□ 1.81
CENPF-202ENST00000464322 ARAP1Q96P48 1450 aa26.36■■□□□ 1.81
CENPF-202ENST00000464322 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
CENPF-202ENST00000464322 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CENPF-202ENST00000464322 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
CENPF-202ENST00000464322 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.31■■□□□ 1.8
CENPF-202ENST00000464322 SOGA1O94964 1423 aa26.31■■□□□ 1.8
CENPF-202ENST00000464322 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
CENPF-202ENST00000464322 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.19■■□□□ 1.78
CENPF-202ENST00000464322 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.13■■□□□ 1.77
CENPF-202ENST00000464322 SYNJ1O43426 1573 aa26.08■■□□□ 1.77
CENPF-202ENST00000464322 GRIN2BQ13224 1484 aa26.07■■□□□ 1.76
CENPF-202ENST00000464322 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CENPF-202ENST00000464322 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.05■■□□□ 1.76
CENPF-202ENST00000464322 WDR97A6NE52 1622 aa26.01■■□□□ 1.75
CENPF-202ENST00000464322 SYNJ2O15056 1496 aa26.01■■□□□ 1.75
CENPF-202ENST00000464322 CUX1P39880 1505 aa26.01■■□□□ 1.75
CENPF-202ENST00000464322 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.94■■□□□ 1.74
CENPF-202ENST00000464322 PBRM1Q86U86 1689 aa25.8■■□□□ 1.72
CENPF-202ENST00000464322 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.78■■□□□ 1.72
CENPF-202ENST00000464322 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
CENPF-202ENST00000464322 GRIN2AQ12879 1464 aa25.7■■□□□ 1.7
CENPF-202ENST00000464322 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.7■■□□□ 1.7
CENPF-202ENST00000464322 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.69■■□□□ 1.7
CENPF-202ENST00000464322 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.68■■□□□ 1.7
CENPF-202ENST00000464322 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
CENPF-202ENST00000464322 CEP170Q5SW79 1584 aa25.61■■□□□ 1.69
CENPF-202ENST00000464322 NUP160Q12769 1436 aa25.61■■□□□ 1.69
CENPF-202ENST00000464322 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.59■■□□□ 1.69
CENPF-202ENST00000464322 ADAMTS12P58397 1594 aa25.56■■□□□ 1.68
CENPF-202ENST00000464322 JPH4Q96JJ6 628 aa25.52■■□□□ 1.68
CENPF-202ENST00000464322 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.67
CENPF-202ENST00000464322 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CENPF-202ENST00000464322 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.46■■□□□ 1.67
CENPF-202ENST00000464322 TOP2BQ02880 1626 aa25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 138.7 ms