Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERV3-1Q14264 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERV3-1Q14264 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERV3-1Q14264 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERV3-1Q14264 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERV3-1Q14264 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERV3-1Q14264 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERV3-1Q14264 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERV3-1Q14264 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERV3-1Q14264 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERV3-1Q14264 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERV3-1Q14264 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERV3-1Q14264 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERV3-1Q14264 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERV3-1Q14264 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERV3-1Q14264 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERV3-1Q14264 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERV3-1Q14264 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERV3-1Q14264 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERV3-1Q14264 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERV3-1Q14264 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERV3-1Q14264 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERV3-1Q14264 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERV3-1Q14264 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ERV3-1Q14264 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERV3-1Q14264 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERV3-1Q14264 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERV3-1Q14264 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERV3-1Q14264 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERV3-1Q14264 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERV3-1Q14264 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERV3-1Q14264 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERV3-1Q14264 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERV3-1Q14264 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERV3-1Q14264 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERV3-1Q14264 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERV3-1Q14264 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERV3-1Q14264 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ERV3-1Q14264 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERV3-1Q14264 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERV3-1Q14264 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERV3-1Q14264 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERV3-1Q14264 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERV3-1Q14264 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERV3-1Q14264 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERV3-1Q14264 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERV3-1Q14264 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERV3-1Q14264 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERV3-1Q14264 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERV3-1Q14264 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERV3-1Q14264 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERV3-1Q14264 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERV3-1Q14264 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERV3-1Q14264 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERV3-1Q14264 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERV3-1Q14264 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERV3-1Q14264 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERV3-1Q14264 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERV3-1Q14264 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERV3-1Q14264 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERV3-1Q14264 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERV3-1Q14264 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERV3-1Q14264 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERV3-1Q14264 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERV3-1Q14264 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERV3-1Q14264 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERV3-1Q14264 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERV3-1Q14264 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERV3-1Q14264 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERV3-1Q14264 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERV3-1Q14264 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERV3-1Q14264 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERV3-1Q14264 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERV3-1Q14264 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERV3-1Q14264 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERV3-1Q14264 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERV3-1Q14264 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERV3-1Q14264 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERV3-1Q14264 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERV3-1Q14264 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERV3-1Q14264 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERV3-1Q14264 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERV3-1Q14264 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERV3-1Q14264 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERV3-1Q14264 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERV3-1Q14264 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ERV3-1Q14264 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERV3-1Q14264 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERV3-1Q14264 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERV3-1Q14264 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERV3-1Q14264 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERV3-1Q14264 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERV3-1Q14264 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERV3-1Q14264 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERV3-1Q14264 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERV3-1Q14264 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERV3-1Q14264 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERV3-1Q14264 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERV3-1Q14264 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERV3-1Q14264 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms