Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
COL9A3Q14050 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
COL9A3Q14050 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
COL9A3Q14050 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
COL9A3Q14050 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
COL9A3Q14050 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
COL9A3Q14050 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
COL9A3Q14050 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
COL9A3Q14050 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
COL9A3Q14050 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
COL9A3Q14050 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
COL9A3Q14050 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
COL9A3Q14050 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
COL9A3Q14050 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
COL9A3Q14050 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
COL9A3Q14050 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
COL9A3Q14050 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
COL9A3Q14050 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
COL9A3Q14050 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
COL9A3Q14050 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
COL9A3Q14050 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
COL9A3Q14050 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
COL9A3Q14050 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
COL9A3Q14050 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
COL9A3Q14050 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
COL9A3Q14050 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
COL9A3Q14050 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
COL9A3Q14050 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
COL9A3Q14050 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
COL9A3Q14050 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
COL9A3Q14050 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
COL9A3Q14050 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
COL9A3Q14050 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
COL9A3Q14050 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
COL9A3Q14050 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
COL9A3Q14050 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
COL9A3Q14050 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
COL9A3Q14050 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
COL9A3Q14050 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
COL9A3Q14050 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
COL9A3Q14050 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
COL9A3Q14050 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
COL9A3Q14050 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
COL9A3Q14050 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
COL9A3Q14050 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
COL9A3Q14050 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
COL9A3Q14050 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
COL9A3Q14050 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
COL9A3Q14050 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
COL9A3Q14050 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
COL9A3Q14050 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
COL9A3Q14050 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
COL9A3Q14050 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
COL9A3Q14050 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
COL9A3Q14050 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
COL9A3Q14050 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
COL9A3Q14050 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
COL9A3Q14050 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
COL9A3Q14050 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
COL9A3Q14050 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
COL9A3Q14050 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
COL9A3Q14050 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
COL9A3Q14050 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
COL9A3Q14050 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
COL9A3Q14050 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
COL9A3Q14050 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
COL9A3Q14050 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
COL9A3Q14050 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
COL9A3Q14050 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
COL9A3Q14050 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
COL9A3Q14050 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
COL9A3Q14050 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
COL9A3Q14050 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
COL9A3Q14050 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
COL9A3Q14050 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
COL9A3Q14050 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
COL9A3Q14050 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
COL9A3Q14050 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
COL9A3Q14050 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
COL9A3Q14050 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
COL9A3Q14050 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
COL9A3Q14050 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
COL9A3Q14050 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
COL9A3Q14050 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
COL9A3Q14050 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
COL9A3Q14050 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
COL9A3Q14050 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
COL9A3Q14050 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
COL9A3Q14050 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
COL9A3Q14050 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
COL9A3Q14050 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
COL9A3Q14050 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
COL9A3Q14050 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
COL9A3Q14050 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
COL9A3Q14050 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
COL9A3Q14050 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
COL9A3Q14050 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
COL9A3Q14050 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
COL9A3Q14050 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
COL9A3Q14050 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
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