Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE7AQ13946 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE7AQ13946 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE7AQ13946 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE7AQ13946 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE7AQ13946 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE7AQ13946 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE7AQ13946 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE7AQ13946 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE7AQ13946 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE7AQ13946 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE7AQ13946 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE7AQ13946 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE7AQ13946 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE7AQ13946 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE7AQ13946 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE7AQ13946 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE7AQ13946 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE7AQ13946 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE7AQ13946 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE7AQ13946 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE7AQ13946 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE7AQ13946 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE7AQ13946 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE7AQ13946 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE7AQ13946 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE7AQ13946 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE7AQ13946 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE7AQ13946 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE7AQ13946 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE7AQ13946 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE7AQ13946 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE7AQ13946 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE7AQ13946 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE7AQ13946 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE7AQ13946 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE7AQ13946 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE7AQ13946 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE7AQ13946 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE7AQ13946 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE7AQ13946 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE7AQ13946 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE7AQ13946 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE7AQ13946 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE7AQ13946 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE7AQ13946 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE7AQ13946 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE7AQ13946 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE7AQ13946 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE7AQ13946 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE7AQ13946 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE7AQ13946 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE7AQ13946 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE7AQ13946 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE7AQ13946 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE7AQ13946 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE7AQ13946 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE7AQ13946 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE7AQ13946 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE7AQ13946 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE7AQ13946 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE7AQ13946 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE7AQ13946 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE7AQ13946 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE7AQ13946 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE7AQ13946 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE7AQ13946 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE7AQ13946 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE7AQ13946 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE7AQ13946 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE7AQ13946 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE7AQ13946 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE7AQ13946 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE7AQ13946 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE7AQ13946 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE7AQ13946 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE7AQ13946 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE7AQ13946 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE7AQ13946 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE7AQ13946 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE7AQ13946 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE7AQ13946 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE7AQ13946 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE7AQ13946 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE7AQ13946 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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