Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2H2Q13888 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2H2Q13888 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2H2Q13888 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2H2Q13888 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2H2Q13888 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2H2Q13888 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2H2Q13888 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2H2Q13888 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2H2Q13888 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2H2Q13888 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2H2Q13888 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2H2Q13888 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2H2Q13888 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2H2Q13888 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2H2Q13888 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2H2Q13888 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2H2Q13888 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2H2Q13888 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2H2Q13888 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2H2Q13888 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2H2Q13888 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF2H2Q13888 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF2H2Q13888 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2H2Q13888 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2H2Q13888 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2H2Q13888 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2H2Q13888 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2H2Q13888 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2H2Q13888 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2H2Q13888 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2H2Q13888 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2H2Q13888 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2H2Q13888 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2H2Q13888 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2H2Q13888 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2H2Q13888 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2H2Q13888 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2H2Q13888 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2H2Q13888 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2H2Q13888 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2H2Q13888 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2H2Q13888 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2H2Q13888 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2H2Q13888 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2H2Q13888 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2H2Q13888 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2H2Q13888 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2H2Q13888 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2H2Q13888 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2H2Q13888 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2H2Q13888 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2H2Q13888 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2H2Q13888 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2H2Q13888 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2H2Q13888 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2H2Q13888 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2H2Q13888 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2H2Q13888 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2H2Q13888 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2H2Q13888 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2H2Q13888 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2H2Q13888 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2H2Q13888 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2H2Q13888 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2H2Q13888 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2H2Q13888 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2H2Q13888 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2H2Q13888 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2H2Q13888 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2H2Q13888 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GTF2H2Q13888 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
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