Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXOSC2Q13868 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC2Q13868 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC2Q13868 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC2Q13868 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC2Q13868 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC2Q13868 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC2Q13868 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC2Q13868 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC2Q13868 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC2Q13868 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC2Q13868 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC2Q13868 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC2Q13868 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC2Q13868 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC2Q13868 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC2Q13868 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC2Q13868 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC2Q13868 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC2Q13868 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC2Q13868 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC2Q13868 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC2Q13868 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EXOSC2Q13868 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC2Q13868 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC2Q13868 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC2Q13868 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC2Q13868 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC2Q13868 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC2Q13868 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC2Q13868 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC2Q13868 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC2Q13868 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC2Q13868 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC2Q13868 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC2Q13868 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC2Q13868 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC2Q13868 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC2Q13868 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC2Q13868 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXOSC2Q13868 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC2Q13868 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC2Q13868 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC2Q13868 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC2Q13868 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC2Q13868 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC2Q13868 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC2Q13868 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC2Q13868 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC2Q13868 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC2Q13868 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC2Q13868 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC2Q13868 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC2Q13868 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC2Q13868 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC2Q13868 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC2Q13868 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC2Q13868 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC2Q13868 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC2Q13868 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC2Q13868 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC2Q13868 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC2Q13868 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC2Q13868 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXOSC2Q13868 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC2Q13868 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC2Q13868 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC2Q13868 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC2Q13868 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC2Q13868 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC2Q13868 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC2Q13868 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC2Q13868 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC2Q13868 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC2Q13868 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC2Q13868 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC2Q13868 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC2Q13868 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC2Q13868 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC2Q13868 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC2Q13868 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC2Q13868 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC2Q13868 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC2Q13868 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC2Q13868 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC2Q13868 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC2Q13868 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC2Q13868 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC2Q13868 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC2Q13868 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXOSC2Q13868 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXOSC2Q13868 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC2Q13868 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC2Q13868 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC2Q13868 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC2Q13868 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC2Q13868 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC2Q13868 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC2Q13868 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC2Q13868 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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