Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

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Length 1,193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMC2Q13753 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMC2Q13753 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMC2Q13753 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LAMC2Q13753 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMC2Q13753 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMC2Q13753 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMC2Q13753 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMC2Q13753 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMC2Q13753 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMC2Q13753 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMC2Q13753 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMC2Q13753 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
LAMC2Q13753 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMC2Q13753 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMC2Q13753 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMC2Q13753 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LAMC2Q13753 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMC2Q13753 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMC2Q13753 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMC2Q13753 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMC2Q13753 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMC2Q13753 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMC2Q13753 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LAMC2Q13753 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMC2Q13753 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMC2Q13753 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LAMC2Q13753 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
LAMC2Q13753 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LAMC2Q13753 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LAMC2Q13753 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LAMC2Q13753 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LAMC2Q13753 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMC2Q13753 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMC2Q13753 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMC2Q13753 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
LAMC2Q13753 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
LAMC2Q13753 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LAMC2Q13753 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMC2Q13753 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LAMC2Q13753 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LAMC2Q13753 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LAMC2Q13753 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMC2Q13753 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMC2Q13753 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LAMC2Q13753 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMC2Q13753 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LAMC2Q13753 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMC2Q13753 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMC2Q13753 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMC2Q13753 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMC2Q13753 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMC2Q13753 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMC2Q13753 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMC2Q13753 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMC2Q13753 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMC2Q13753 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LAMC2Q13753 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMC2Q13753 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMC2Q13753 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMC2Q13753 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMC2Q13753 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMC2Q13753 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMC2Q13753 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMC2Q13753 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMC2Q13753 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMC2Q13753 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMC2Q13753 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMC2Q13753 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMC2Q13753 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMC2Q13753 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMC2Q13753 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMC2Q13753 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMC2Q13753 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMC2Q13753 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMC2Q13753 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMC2Q13753 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMC2Q13753 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMC2Q13753 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMC2Q13753 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMC2Q13753 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMC2Q13753 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMC2Q13753 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMC2Q13753 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMC2Q13753 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMC2Q13753 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMC2Q13753 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMC2Q13753 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMC2Q13753 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMC2Q13753 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMC2Q13753 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMC2Q13753 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMC2Q13753 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMC2Q13753 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMC2Q13753 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMC2Q13753 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMC2Q13753 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LAMC2Q13753 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LAMC2Q13753 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LAMC2Q13753 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
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