Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEX6Q13608 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEX6Q13608 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PEX6Q13608 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PEX6Q13608 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PEX6Q13608 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PEX6Q13608 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PEX6Q13608 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PEX6Q13608 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PEX6Q13608 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PEX6Q13608 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PEX6Q13608 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PEX6Q13608 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PEX6Q13608 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PEX6Q13608 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PEX6Q13608 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PEX6Q13608 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PEX6Q13608 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PEX6Q13608 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PEX6Q13608 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PEX6Q13608 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PEX6Q13608 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PEX6Q13608 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PEX6Q13608 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PEX6Q13608 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PEX6Q13608 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PEX6Q13608 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PEX6Q13608 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PEX6Q13608 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PEX6Q13608 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PEX6Q13608 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PEX6Q13608 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PEX6Q13608 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PEX6Q13608 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX6Q13608 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PEX6Q13608 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PEX6Q13608 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PEX6Q13608 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PEX6Q13608 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PEX6Q13608 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PEX6Q13608 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PEX6Q13608 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PEX6Q13608 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX6Q13608 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX6Q13608 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX6Q13608 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PEX6Q13608 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PEX6Q13608 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PEX6Q13608 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PEX6Q13608 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PEX6Q13608 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PEX6Q13608 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PEX6Q13608 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PEX6Q13608 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PEX6Q13608 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PEX6Q13608 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PEX6Q13608 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PEX6Q13608 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PEX6Q13608 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PEX6Q13608 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PEX6Q13608 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PEX6Q13608 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PEX6Q13608 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PEX6Q13608 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PEX6Q13608 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PEX6Q13608 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PEX6Q13608 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PEX6Q13608 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
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