Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIPK1Q13546 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIPK1Q13546 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK1Q13546 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RIPK1Q13546 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIPK1Q13546 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPK1Q13546 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
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