Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLD1Q13393 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLD1Q13393 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLD1Q13393 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLD1Q13393 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLD1Q13393 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLD1Q13393 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLD1Q13393 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLD1Q13393 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLD1Q13393 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLD1Q13393 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLD1Q13393 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PLD1Q13393 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLD1Q13393 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLD1Q13393 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLD1Q13393 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLD1Q13393 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLD1Q13393 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLD1Q13393 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLD1Q13393 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLD1Q13393 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLD1Q13393 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLD1Q13393 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLD1Q13393 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLD1Q13393 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLD1Q13393 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLD1Q13393 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLD1Q13393 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLD1Q13393 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLD1Q13393 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLD1Q13393 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLD1Q13393 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLD1Q13393 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLD1Q13393 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLD1Q13393 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLD1Q13393 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLD1Q13393 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLD1Q13393 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
PLD1Q13393 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLD1Q13393 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLD1Q13393 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PLD1Q13393 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLD1Q13393 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLD1Q13393 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PLD1Q13393 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLD1Q13393 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLD1Q13393 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLD1Q13393 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLD1Q13393 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLD1Q13393 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PLD1Q13393 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLD1Q13393 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLD1Q13393 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLD1Q13393 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLD1Q13393 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLD1Q13393 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PLD1Q13393 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLD1Q13393 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLD1Q13393 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLD1Q13393 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLD1Q13393 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLD1Q13393 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLD1Q13393 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLD1Q13393 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLD1Q13393 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLD1Q13393 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLD1Q13393 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLD1Q13393 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLD1Q13393 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLD1Q13393 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLD1Q13393 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLD1Q13393 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PLD1Q13393 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PLD1Q13393 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 433.6 ms