Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRSQ13332 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRSQ13332 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRSQ13332 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRSQ13332 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRSQ13332 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRSQ13332 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRSQ13332 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRSQ13332 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRSQ13332 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRSQ13332 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRSQ13332 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRSQ13332 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRSQ13332 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRSQ13332 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRSQ13332 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRSQ13332 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRSQ13332 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRSQ13332 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRSQ13332 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRSQ13332 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRSQ13332 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRSQ13332 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRSQ13332 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRSQ13332 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRSQ13332 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRSQ13332 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRSQ13332 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRSQ13332 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRSQ13332 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRSQ13332 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRSQ13332 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRSQ13332 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRSQ13332 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRSQ13332 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRSQ13332 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRSQ13332 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRSQ13332 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRSQ13332 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRSQ13332 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRSQ13332 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRSQ13332 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRSQ13332 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRSQ13332 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRSQ13332 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRSQ13332 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRSQ13332 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRSQ13332 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRSQ13332 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRSQ13332 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRSQ13332 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRSQ13332 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRSQ13332 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRSQ13332 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRSQ13332 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRSQ13332 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRSQ13332 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRSQ13332 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRSQ13332 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
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PTPRSQ13332 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRSQ13332 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRSQ13332 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRSQ13332 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRSQ13332 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRSQ13332 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
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PTPRSQ13332 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRSQ13332 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
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PTPRSQ13332 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
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PTPRSQ13332 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRSQ13332 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
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PTPRSQ13332 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRSQ13332 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRSQ13332 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRSQ13332 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRSQ13332 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRSQ13332 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRSQ13332 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRSQ13332 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
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PTPRSQ13332 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRSQ13332 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRSQ13332 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRSQ13332 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRSQ13332 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRSQ13332 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRSQ13332 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRSQ13332 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRSQ13332 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRSQ13332 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRSQ13332 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRSQ13332 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRSQ13332 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRSQ13332 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
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