Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SEMA3FQ13275 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SEMA3FQ13275 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SEMA3FQ13275 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SEMA3FQ13275 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SEMA3FQ13275 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SEMA3FQ13275 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEMA3FQ13275 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEMA3FQ13275 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEMA3FQ13275 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEMA3FQ13275 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEMA3FQ13275 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SEMA3FQ13275 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEMA3FQ13275 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEMA3FQ13275 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SEMA3FQ13275 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SEMA3FQ13275 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SEMA3FQ13275 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SEMA3FQ13275 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SEMA3FQ13275 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SEMA3FQ13275 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SEMA3FQ13275 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SEMA3FQ13275 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SEMA3FQ13275 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SEMA3FQ13275 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SEMA3FQ13275 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SEMA3FQ13275 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SEMA3FQ13275 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SEMA3FQ13275 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SEMA3FQ13275 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SEMA3FQ13275 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SEMA3FQ13275 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SEMA3FQ13275 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SEMA3FQ13275 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SEMA3FQ13275 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SEMA3FQ13275 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SEMA3FQ13275 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SEMA3FQ13275 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SEMA3FQ13275 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SEMA3FQ13275 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SEMA3FQ13275 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SEMA3FQ13275 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SEMA3FQ13275 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SEMA3FQ13275 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SEMA3FQ13275 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SEMA3FQ13275 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SEMA3FQ13275 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SEMA3FQ13275 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SEMA3FQ13275 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SEMA3FQ13275 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SEMA3FQ13275 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SEMA3FQ13275 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SEMA3FQ13275 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SEMA3FQ13275 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SEMA3FQ13275 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SEMA3FQ13275 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SEMA3FQ13275 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SEMA3FQ13275 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SEMA3FQ13275 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SEMA3FQ13275 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SEMA3FQ13275 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SEMA3FQ13275 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SEMA3FQ13275 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SEMA3FQ13275 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SEMA3FQ13275 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SEMA3FQ13275 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SEMA3FQ13275 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SEMA3FQ13275 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SEMA3FQ13275 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEMA3FQ13275 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEMA3FQ13275 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEMA3FQ13275 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEMA3FQ13275 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEMA3FQ13275 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEMA3FQ13275 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SEMA3FQ13275 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SEMA3FQ13275 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SEMA3FQ13275 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SEMA3FQ13275 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SEMA3FQ13275 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SEMA3FQ13275 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SEMA3FQ13275 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SEMA3FQ13275 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SEMA3FQ13275 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SEMA3FQ13275 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SEMA3FQ13275 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SEMA3FQ13275 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SEMA3FQ13275 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SEMA3FQ13275 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
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