Protein–RNA interactions for Protein: Q08AN1

ZNF616, Zinc finger protein 616, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF616Q08AN1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF616Q08AN1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF616Q08AN1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF616Q08AN1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF616Q08AN1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF616Q08AN1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF616Q08AN1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF616Q08AN1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF616Q08AN1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF616Q08AN1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF616Q08AN1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF616Q08AN1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF616Q08AN1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF616Q08AN1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF616Q08AN1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF616Q08AN1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF616Q08AN1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF616Q08AN1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF616Q08AN1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF616Q08AN1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF616Q08AN1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF616Q08AN1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF616Q08AN1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF616Q08AN1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZNF616Q08AN1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF616Q08AN1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF616Q08AN1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF616Q08AN1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF616Q08AN1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF616Q08AN1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF616Q08AN1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF616Q08AN1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF616Q08AN1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF616Q08AN1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF616Q08AN1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF616Q08AN1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF616Q08AN1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF616Q08AN1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF616Q08AN1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF616Q08AN1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF616Q08AN1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF616Q08AN1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF616Q08AN1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF616Q08AN1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF616Q08AN1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF616Q08AN1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF616Q08AN1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF616Q08AN1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF616Q08AN1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF616Q08AN1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF616Q08AN1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF616Q08AN1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF616Q08AN1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF616Q08AN1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF616Q08AN1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF616Q08AN1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF616Q08AN1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF616Q08AN1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF616Q08AN1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF616Q08AN1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF616Q08AN1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF616Q08AN1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF616Q08AN1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF616Q08AN1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF616Q08AN1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF616Q08AN1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF616Q08AN1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF616Q08AN1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF616Q08AN1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms