Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
REG3AQ06141 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
REG3AQ06141 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
REG3AQ06141 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
REG3AQ06141 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
REG3AQ06141 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
REG3AQ06141 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
REG3AQ06141 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
REG3AQ06141 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
REG3AQ06141 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
REG3AQ06141 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
REG3AQ06141 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
REG3AQ06141 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
REG3AQ06141 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
REG3AQ06141 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
REG3AQ06141 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REG3AQ06141 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REG3AQ06141 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
REG3AQ06141 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
REG3AQ06141 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
REG3AQ06141 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
REG3AQ06141 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
REG3AQ06141 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
REG3AQ06141 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
REG3AQ06141 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
REG3AQ06141 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
REG3AQ06141 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
REG3AQ06141 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
REG3AQ06141 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REG3AQ06141 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms