Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
IRX3P78415 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
IRX3P78415 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
IRX3P78415 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
IRX3P78415 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
IRX3P78415 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
IRX3P78415 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
IRX3P78415 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
IRX3P78415 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
IRX3P78415 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
IRX3P78415 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
IRX3P78415 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
IRX3P78415 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
IRX3P78415 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
IRX3P78415 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
IRX3P78415 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
IRX3P78415 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
IRX3P78415 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
IRX3P78415 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
IRX3P78415 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
IRX3P78415 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
IRX3P78415 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
IRX3P78415 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
IRX3P78415 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
IRX3P78415 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
IRX3P78415 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
IRX3P78415 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
IRX3P78415 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
IRX3P78415 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
IRX3P78415 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
IRX3P78415 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
IRX3P78415 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
IRX3P78415 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
IRX3P78415 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
IRX3P78415 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
IRX3P78415 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
IRX3P78415 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
IRX3P78415 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
IRX3P78415 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
IRX3P78415 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
IRX3P78415 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
IRX3P78415 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
IRX3P78415 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
IRX3P78415 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
IRX3P78415 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
IRX3P78415 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
IRX3P78415 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
IRX3P78415 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
IRX3P78415 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
IRX3P78415 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
IRX3P78415 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
IRX3P78415 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
IRX3P78415 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
IRX3P78415 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
IRX3P78415 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
IRX3P78415 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
IRX3P78415 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IRX3P78415 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IRX3P78415 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
IRX3P78415 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IRX3P78415 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IRX3P78415 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IRX3P78415 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
IRX3P78415 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
IRX3P78415 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
IRX3P78415 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
IRX3P78415 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
IRX3P78415 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
IRX3P78415 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
IRX3P78415 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
IRX3P78415 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IRX3P78415 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
IRX3P78415 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
IRX3P78415 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IRX3P78415 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
IRX3P78415 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IRX3P78415 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IRX3P78415 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IRX3P78415 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IRX3P78415 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IRX3P78415 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IRX3P78415 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IRX3P78415 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IRX3P78415 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IRX3P78415 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IRX3P78415 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IRX3P78415 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IRX3P78415 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IRX3P78415 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IRX3P78415 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IRX3P78415 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IRX3P78415 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IRX3P78415 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IRX3P78415 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IRX3P78415 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IRX3P78415 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IRX3P78415 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
IRX3P78415 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
IRX3P78415 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
IRX3P78415 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms