Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ASIC1P78348 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ASIC1P78348 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ASIC1P78348 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ASIC1P78348 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ASIC1P78348 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ASIC1P78348 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ASIC1P78348 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ASIC1P78348 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ASIC1P78348 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ASIC1P78348 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ASIC1P78348 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ASIC1P78348 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ASIC1P78348 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ASIC1P78348 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ASIC1P78348 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ASIC1P78348 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ASIC1P78348 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ASIC1P78348 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ASIC1P78348 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ASIC1P78348 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ASIC1P78348 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ASIC1P78348 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ASIC1P78348 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ASIC1P78348 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ASIC1P78348 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ASIC1P78348 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ASIC1P78348 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ASIC1P78348 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ASIC1P78348 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ASIC1P78348 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ASIC1P78348 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ASIC1P78348 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ASIC1P78348 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ASIC1P78348 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ASIC1P78348 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ASIC1P78348 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ASIC1P78348 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ASIC1P78348 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ASIC1P78348 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ASIC1P78348 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ASIC1P78348 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ASIC1P78348 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ASIC1P78348 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ASIC1P78348 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ASIC1P78348 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ASIC1P78348 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ASIC1P78348 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ASIC1P78348 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ASIC1P78348 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ASIC1P78348 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ASIC1P78348 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ASIC1P78348 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ASIC1P78348 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ASIC1P78348 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ASIC1P78348 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ASIC1P78348 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ASIC1P78348 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ASIC1P78348 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ASIC1P78348 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ASIC1P78348 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ASIC1P78348 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ASIC1P78348 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ASIC1P78348 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ASIC1P78348 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ASIC1P78348 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ASIC1P78348 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ASIC1P78348 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ASIC1P78348 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ASIC1P78348 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ASIC1P78348 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ASIC1P78348 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ASIC1P78348 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ASIC1P78348 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ASIC1P78348 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ASIC1P78348 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ASIC1P78348 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ASIC1P78348 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ASIC1P78348 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ASIC1P78348 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ASIC1P78348 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ASIC1P78348 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ASIC1P78348 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ASIC1P78348 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ASIC1P78348 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ASIC1P78348 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ASIC1P78348 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ASIC1P78348 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ASIC1P78348 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ASIC1P78348 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ASIC1P78348 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ASIC1P78348 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ASIC1P78348 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ASIC1P78348 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ASIC1P78348 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ASIC1P78348 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ASIC1P78348 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ASIC1P78348 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ASIC1P78348 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ASIC1P78348 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms