Protein–RNA interactions for Protein: P78324

SIRPA, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPAP78324 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRPAP78324 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SIRPAP78324 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRPAP78324 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRPAP78324 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SIRPAP78324 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRPAP78324 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRPAP78324 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRPAP78324 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SIRPAP78324 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIRPAP78324 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRPAP78324 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIRPAP78324 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIRPAP78324 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIRPAP78324 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRPAP78324 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRPAP78324 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIRPAP78324 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRPAP78324 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRPAP78324 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRPAP78324 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIRPAP78324 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRPAP78324 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRPAP78324 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRPAP78324 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIRPAP78324 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRPAP78324 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRPAP78324 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRPAP78324 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRPAP78324 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRPAP78324 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRPAP78324 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRPAP78324 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIRPAP78324 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIRPAP78324 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIRPAP78324 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms