Protein–RNA interactions for Protein: P63244

RACK1, Receptor of activated protein C kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RACK1P63244 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RACK1P63244 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RACK1P63244 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RACK1P63244 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RACK1P63244 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RACK1P63244 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RACK1P63244 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RACK1P63244 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RACK1P63244 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RACK1P63244 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RACK1P63244 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RACK1P63244 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RACK1P63244 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RACK1P63244 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RACK1P63244 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RACK1P63244 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RACK1P63244 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RACK1P63244 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RACK1P63244 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RACK1P63244 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RACK1P63244 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RACK1P63244 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RACK1P63244 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RACK1P63244 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RACK1P63244 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RACK1P63244 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RACK1P63244 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RACK1P63244 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RACK1P63244 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RACK1P63244 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RACK1P63244 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RACK1P63244 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RACK1P63244 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RACK1P63244 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RACK1P63244 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RACK1P63244 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RACK1P63244 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RACK1P63244 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RACK1P63244 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RACK1P63244 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RACK1P63244 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RACK1P63244 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RACK1P63244 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RACK1P63244 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RACK1P63244 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RACK1P63244 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RACK1P63244 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RACK1P63244 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RACK1P63244 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RACK1P63244 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RACK1P63244 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RACK1P63244 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RACK1P63244 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RACK1P63244 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RACK1P63244 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RACK1P63244 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RACK1P63244 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RACK1P63244 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RACK1P63244 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RACK1P63244 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RACK1P63244 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RACK1P63244 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RACK1P63244 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RACK1P63244 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RACK1P63244 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RACK1P63244 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RACK1P63244 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RACK1P63244 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RACK1P63244 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RACK1P63244 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RACK1P63244 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RACK1P63244 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RACK1P63244 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RACK1P63244 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RACK1P63244 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RACK1P63244 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RACK1P63244 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RACK1P63244 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RACK1P63244 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RACK1P63244 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RACK1P63244 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RACK1P63244 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RACK1P63244 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RACK1P63244 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RACK1P63244 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RACK1P63244 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RACK1P63244 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RACK1P63244 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RACK1P63244 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RACK1P63244 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RACK1P63244 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RACK1P63244 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RACK1P63244 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RACK1P63244 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RACK1P63244 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RACK1P63244 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RACK1P63244 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RACK1P63244 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RACK1P63244 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RACK1P63244 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms