Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VSNL1P62760 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VSNL1P62760 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VSNL1P62760 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VSNL1P62760 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VSNL1P62760 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VSNL1P62760 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VSNL1P62760 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VSNL1P62760 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VSNL1P62760 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VSNL1P62760 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VSNL1P62760 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
VSNL1P62760 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VSNL1P62760 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VSNL1P62760 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VSNL1P62760 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSNL1P62760 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSNL1P62760 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSNL1P62760 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VSNL1P62760 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSNL1P62760 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSNL1P62760 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSNL1P62760 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSNL1P62760 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSNL1P62760 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSNL1P62760 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSNL1P62760 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VSNL1P62760 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
VSNL1P62760 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VSNL1P62760 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VSNL1P62760 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VSNL1P62760 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VSNL1P62760 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VSNL1P62760 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VSNL1P62760 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VSNL1P62760 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VSNL1P62760 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VSNL1P62760 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VSNL1P62760 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VSNL1P62760 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VSNL1P62760 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VSNL1P62760 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VSNL1P62760 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VSNL1P62760 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VSNL1P62760 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VSNL1P62760 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VSNL1P62760 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
VSNL1P62760 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VSNL1P62760 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VSNL1P62760 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VSNL1P62760 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VSNL1P62760 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VSNL1P62760 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VSNL1P62760 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VSNL1P62760 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VSNL1P62760 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VSNL1P62760 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VSNL1P62760 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VSNL1P62760 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VSNL1P62760 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VSNL1P62760 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VSNL1P62760 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VSNL1P62760 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VSNL1P62760 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VSNL1P62760 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSNL1P62760 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSNL1P62760 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSNL1P62760 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSNL1P62760 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VSNL1P62760 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VSNL1P62760 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
VSNL1P62760 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VSNL1P62760 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VSNL1P62760 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VSNL1P62760 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VSNL1P62760 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VSNL1P62760 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VSNL1P62760 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSNL1P62760 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSNL1P62760 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSNL1P62760 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
VSNL1P62760 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
VSNL1P62760 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
VSNL1P62760 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VSNL1P62760 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VSNL1P62760 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VSNL1P62760 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VSNL1P62760 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VSNL1P62760 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VSNL1P62760 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VSNL1P62760 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VSNL1P62760 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VSNL1P62760 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VSNL1P62760 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VSNL1P62760 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VSNL1P62760 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VSNL1P62760 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VSNL1P62760 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VSNL1P62760 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VSNL1P62760 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms