Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ACLYP53396 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ACLYP53396 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ACLYP53396 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ACLYP53396 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ACLYP53396 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ACLYP53396 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ACLYP53396 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ACLYP53396 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ACLYP53396 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ACLYP53396 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ACLYP53396 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ACLYP53396 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ACLYP53396 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ACLYP53396 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ACLYP53396 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ACLYP53396 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ACLYP53396 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ACLYP53396 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ACLYP53396 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ACLYP53396 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ACLYP53396 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ACLYP53396 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ACLYP53396 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ACLYP53396 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ACLYP53396 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ACLYP53396 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ACLYP53396 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ACLYP53396 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ACLYP53396 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ACLYP53396 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ACLYP53396 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ACLYP53396 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ACLYP53396 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ACLYP53396 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ACLYP53396 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ACLYP53396 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ACLYP53396 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ACLYP53396 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ACLYP53396 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ACLYP53396 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ACLYP53396 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ACLYP53396 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ACLYP53396 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ACLYP53396 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ACLYP53396 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ACLYP53396 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ACLYP53396 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ACLYP53396 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ACLYP53396 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ACLYP53396 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ACLYP53396 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ACLYP53396 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ACLYP53396 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ACLYP53396 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ACLYP53396 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACLYP53396 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACLYP53396 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACLYP53396 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACLYP53396 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACLYP53396 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ACLYP53396 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ACLYP53396 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ACLYP53396 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ACLYP53396 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ACLYP53396 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ACLYP53396 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ACLYP53396 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ACLYP53396 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ACLYP53396 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ACLYP53396 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ACLYP53396 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ACLYP53396 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ACLYP53396 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ACLYP53396 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ACLYP53396 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ACLYP53396 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ACLYP53396 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ACLYP53396 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ACLYP53396 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ACLYP53396 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ACLYP53396 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ACLYP53396 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ACLYP53396 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ACLYP53396 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ACLYP53396 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ACLYP53396 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ACLYP53396 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ACLYP53396 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ACLYP53396 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ACLYP53396 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACLYP53396 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACLYP53396 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACLYP53396 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACLYP53396 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACLYP53396 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ACLYP53396 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ACLYP53396 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ACLYP53396 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ACLYP53396 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 292.5 ms