Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ARFIP1P53367 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARFIP1P53367 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARFIP1P53367 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARFIP1P53367 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFIP1P53367 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFIP1P53367 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFIP1P53367 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFIP1P53367 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFIP1P53367 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFIP1P53367 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFIP1P53367 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFIP1P53367 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFIP1P53367 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFIP1P53367 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFIP1P53367 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARFIP1P53367 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARFIP1P53367 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARFIP1P53367 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARFIP1P53367 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFIP1P53367 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFIP1P53367 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFIP1P53367 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFIP1P53367 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFIP1P53367 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFIP1P53367 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFIP1P53367 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARFIP1P53367 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARFIP1P53367 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARFIP1P53367 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARFIP1P53367 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARFIP1P53367 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARFIP1P53367 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARFIP1P53367 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARFIP1P53367 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFIP1P53367 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARFIP1P53367 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARFIP1P53367 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFIP1P53367 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFIP1P53367 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFIP1P53367 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFIP1P53367 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFIP1P53367 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFIP1P53367 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFIP1P53367 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARFIP1P53367 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARFIP1P53367 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARFIP1P53367 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARFIP1P53367 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFIP1P53367 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFIP1P53367 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFIP1P53367 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFIP1P53367 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFIP1P53367 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFIP1P53367 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFIP1P53367 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFIP1P53367 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFIP1P53367 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFIP1P53367 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFIP1P53367 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFIP1P53367 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFIP1P53367 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFIP1P53367 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFIP1P53367 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFIP1P53367 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFIP1P53367 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFIP1P53367 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFIP1P53367 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFIP1P53367 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFIP1P53367 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFIP1P53367 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFIP1P53367 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFIP1P53367 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFIP1P53367 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms