Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
VEGFBP49765 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
VEGFBP49765 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
VEGFBP49765 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
VEGFBP49765 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
VEGFBP49765 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
VEGFBP49765 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
VEGFBP49765 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
VEGFBP49765 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
VEGFBP49765 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
VEGFBP49765 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
VEGFBP49765 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
VEGFBP49765 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
VEGFBP49765 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
VEGFBP49765 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
VEGFBP49765 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
VEGFBP49765 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
VEGFBP49765 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
VEGFBP49765 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
VEGFBP49765 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
VEGFBP49765 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
VEGFBP49765 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
VEGFBP49765 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
VEGFBP49765 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
VEGFBP49765 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
VEGFBP49765 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
VEGFBP49765 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
VEGFBP49765 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
VEGFBP49765 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
VEGFBP49765 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
VEGFBP49765 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
VEGFBP49765 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
VEGFBP49765 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
VEGFBP49765 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
VEGFBP49765 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
VEGFBP49765 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
VEGFBP49765 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
VEGFBP49765 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
VEGFBP49765 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
VEGFBP49765 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
VEGFBP49765 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
VEGFBP49765 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
VEGFBP49765 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
VEGFBP49765 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
VEGFBP49765 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
VEGFBP49765 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
VEGFBP49765 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
VEGFBP49765 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
VEGFBP49765 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
VEGFBP49765 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
VEGFBP49765 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
VEGFBP49765 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
VEGFBP49765 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
VEGFBP49765 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
VEGFBP49765 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
VEGFBP49765 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
VEGFBP49765 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
VEGFBP49765 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
VEGFBP49765 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
VEGFBP49765 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
VEGFBP49765 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
VEGFBP49765 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
VEGFBP49765 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
VEGFBP49765 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
VEGFBP49765 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
VEGFBP49765 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
VEGFBP49765 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
VEGFBP49765 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
VEGFBP49765 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
VEGFBP49765 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
VEGFBP49765 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
VEGFBP49765 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
VEGFBP49765 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
VEGFBP49765 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
VEGFBP49765 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
VEGFBP49765 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
VEGFBP49765 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
VEGFBP49765 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
VEGFBP49765 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
VEGFBP49765 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
VEGFBP49765 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
VEGFBP49765 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
VEGFBP49765 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
VEGFBP49765 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
VEGFBP49765 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
VEGFBP49765 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
VEGFBP49765 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
VEGFBP49765 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
VEGFBP49765 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
VEGFBP49765 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
VEGFBP49765 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
VEGFBP49765 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.69■■■□□ 2.5
VEGFBP49765 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
VEGFBP49765 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
VEGFBP49765 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
VEGFBP49765 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
VEGFBP49765 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
VEGFBP49765 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
VEGFBP49765 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
VEGFBP49765 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms