Protein–RNA interactions for Protein: P43487

RANBP1, Ran-specific GTPase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP1P43487 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RANBP1P43487 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RANBP1P43487 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANBP1P43487 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RANBP1P43487 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANBP1P43487 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANBP1P43487 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANBP1P43487 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANBP1P43487 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANBP1P43487 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANBP1P43487 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANBP1P43487 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RANBP1P43487 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANBP1P43487 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RANBP1P43487 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RANBP1P43487 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RANBP1P43487 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANBP1P43487 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANBP1P43487 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RANBP1P43487 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANBP1P43487 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANBP1P43487 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANBP1P43487 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RANBP1P43487 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANBP1P43487 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RANBP1P43487 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RANBP1P43487 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANBP1P43487 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RANBP1P43487 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANBP1P43487 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANBP1P43487 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANBP1P43487 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANBP1P43487 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANBP1P43487 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RANBP1P43487 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANBP1P43487 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANBP1P43487 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANBP1P43487 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANBP1P43487 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANBP1P43487 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RANBP1P43487 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANBP1P43487 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANBP1P43487 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANBP1P43487 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANBP1P43487 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RANBP1P43487 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANBP1P43487 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANBP1P43487 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANBP1P43487 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RANBP1P43487 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RANBP1P43487 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RANBP1P43487 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RANBP1P43487 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANBP1P43487 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RANBP1P43487 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RANBP1P43487 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANBP1P43487 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANBP1P43487 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANBP1P43487 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RANBP1P43487 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANBP1P43487 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RANBP1P43487 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RANBP1P43487 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RANBP1P43487 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RANBP1P43487 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RANBP1P43487 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANBP1P43487 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANBP1P43487 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANBP1P43487 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RANBP1P43487 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RANBP1P43487 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms