Protein–RNA interactions for Protein: P41180

CASR, Extracellular calcium-sensing receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASRP41180 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASRP41180 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASRP41180 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASRP41180 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASRP41180 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASRP41180 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASRP41180 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASRP41180 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASRP41180 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASRP41180 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASRP41180 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASRP41180 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASRP41180 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASRP41180 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASRP41180 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASRP41180 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASRP41180 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASRP41180 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASRP41180 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASRP41180 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASRP41180 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASRP41180 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASRP41180 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASRP41180 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASRP41180 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASRP41180 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASRP41180 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASRP41180 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASRP41180 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASRP41180 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASRP41180 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASRP41180 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASRP41180 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASRP41180 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASRP41180 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASRP41180 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASRP41180 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASRP41180 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASRP41180 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASRP41180 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASRP41180 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASRP41180 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASRP41180 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASRP41180 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASRP41180 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASRP41180 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASRP41180 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASRP41180 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASRP41180 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASRP41180 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASRP41180 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASRP41180 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASRP41180 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASRP41180 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASRP41180 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASRP41180 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASRP41180 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASRP41180 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASRP41180 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASRP41180 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CASRP41180 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASRP41180 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CASRP41180 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASRP41180 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASRP41180 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASRP41180 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASRP41180 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASRP41180 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASRP41180 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASRP41180 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASRP41180 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASRP41180 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASRP41180 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CASRP41180 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASRP41180 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASRP41180 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASRP41180 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASRP41180 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASRP41180 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASRP41180 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASRP41180 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASRP41180 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASRP41180 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASRP41180 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASRP41180 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASRP41180 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASRP41180 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASRP41180 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASRP41180 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASRP41180 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASRP41180 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASRP41180 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASRP41180 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASRP41180 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASRP41180 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASRP41180 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASRP41180 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASRP41180 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASRP41180 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASRP41180 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms