Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MDH1P40925 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MDH1P40925 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MDH1P40925 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MDH1P40925 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MDH1P40925 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MDH1P40925 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MDH1P40925 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MDH1P40925 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MDH1P40925 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MDH1P40925 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MDH1P40925 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MDH1P40925 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MDH1P40925 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MDH1P40925 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MDH1P40925 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MDH1P40925 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MDH1P40925 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MDH1P40925 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MDH1P40925 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MDH1P40925 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MDH1P40925 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MDH1P40925 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MDH1P40925 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MDH1P40925 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MDH1P40925 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MDH1P40925 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MDH1P40925 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MDH1P40925 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MDH1P40925 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MDH1P40925 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MDH1P40925 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MDH1P40925 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MDH1P40925 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MDH1P40925 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MDH1P40925 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MDH1P40925 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MDH1P40925 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MDH1P40925 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MDH1P40925 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MDH1P40925 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MDH1P40925 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MDH1P40925 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MDH1P40925 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MDH1P40925 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MDH1P40925 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MDH1P40925 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MDH1P40925 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MDH1P40925 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MDH1P40925 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MDH1P40925 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MDH1P40925 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MDH1P40925 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MDH1P40925 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MDH1P40925 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MDH1P40925 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MDH1P40925 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MDH1P40925 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MDH1P40925 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MDH1P40925 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MDH1P40925 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MDH1P40925 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MDH1P40925 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MDH1P40925 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MDH1P40925 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MDH1P40925 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MDH1P40925 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MDH1P40925 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MDH1P40925 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MDH1P40925 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MDH1P40925 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MDH1P40925 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MDH1P40925 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MDH1P40925 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MDH1P40925 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MDH1P40925 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MDH1P40925 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MDH1P40925 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MDH1P40925 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MDH1P40925 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MDH1P40925 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MDH1P40925 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MDH1P40925 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MDH1P40925 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MDH1P40925 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MDH1P40925 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MDH1P40925 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MDH1P40925 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MDH1P40925 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MDH1P40925 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MDH1P40925 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MDH1P40925 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MDH1P40925 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MDH1P40925 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MDH1P40925 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MDH1P40925 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MDH1P40925 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MDH1P40925 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MDH1P40925 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MDH1P40925 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms