Protein–RNA interactions for Protein: P40426

PBX3, Pre-B-cell leukemia transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX3P40426 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBX3P40426 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBX3P40426 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBX3P40426 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBX3P40426 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PBX3P40426 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PBX3P40426 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PBX3P40426 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PBX3P40426 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PBX3P40426 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PBX3P40426 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PBX3P40426 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PBX3P40426 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PBX3P40426 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PBX3P40426 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PBX3P40426 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PBX3P40426 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PBX3P40426 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PBX3P40426 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PBX3P40426 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PBX3P40426 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PBX3P40426 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PBX3P40426 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PBX3P40426 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PBX3P40426 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PBX3P40426 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PBX3P40426 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PBX3P40426 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PBX3P40426 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PBX3P40426 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PBX3P40426 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PBX3P40426 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PBX3P40426 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PBX3P40426 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PBX3P40426 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PBX3P40426 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PBX3P40426 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PBX3P40426 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PBX3P40426 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBX3P40426 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBX3P40426 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBX3P40426 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBX3P40426 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PBX3P40426 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PBX3P40426 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PBX3P40426 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PBX3P40426 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PBX3P40426 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PBX3P40426 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PBX3P40426 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PBX3P40426 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PBX3P40426 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PBX3P40426 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PBX3P40426 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PBX3P40426 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PBX3P40426 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PBX3P40426 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PBX3P40426 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PBX3P40426 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBX3P40426 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBX3P40426 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PBX3P40426 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PBX3P40426 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PBX3P40426 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PBX3P40426 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBX3P40426 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PBX3P40426 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PBX3P40426 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PBX3P40426 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PBX3P40426 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PBX3P40426 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBX3P40426 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBX3P40426 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBX3P40426 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBX3P40426 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PBX3P40426 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PBX3P40426 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBX3P40426 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBX3P40426 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBX3P40426 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PBX3P40426 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PBX3P40426 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBX3P40426 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBX3P40426 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PBX3P40426 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PBX3P40426 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PBX3P40426 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PBX3P40426 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PBX3P40426 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PBX3P40426 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PBX3P40426 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBX3P40426 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBX3P40426 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PBX3P40426 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PBX3P40426 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PBX3P40426 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PBX3P40426 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PBX3P40426 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PBX3P40426 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PBX3P40426 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.6 ms