Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VHLP40337 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VHLP40337 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VHLP40337 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VHLP40337 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VHLP40337 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VHLP40337 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VHLP40337 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VHLP40337 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VHLP40337 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VHLP40337 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VHLP40337 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VHLP40337 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VHLP40337 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VHLP40337 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VHLP40337 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VHLP40337 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VHLP40337 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VHLP40337 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VHLP40337 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VHLP40337 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VHLP40337 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VHLP40337 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VHLP40337 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VHLP40337 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VHLP40337 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VHLP40337 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VHLP40337 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VHLP40337 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VHLP40337 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VHLP40337 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VHLP40337 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VHLP40337 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VHLP40337 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VHLP40337 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VHLP40337 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VHLP40337 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VHLP40337 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VHLP40337 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VHLP40337 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VHLP40337 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VHLP40337 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VHLP40337 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VHLP40337 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VHLP40337 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VHLP40337 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VHLP40337 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VHLP40337 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VHLP40337 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VHLP40337 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VHLP40337 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VHLP40337 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VHLP40337 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VHLP40337 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VHLP40337 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VHLP40337 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VHLP40337 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VHLP40337 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VHLP40337 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VHLP40337 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VHLP40337 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VHLP40337 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VHLP40337 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VHLP40337 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VHLP40337 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VHLP40337 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VHLP40337 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VHLP40337 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VHLP40337 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VHLP40337 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VHLP40337 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VHLP40337 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VHLP40337 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VHLP40337 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VHLP40337 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VHLP40337 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VHLP40337 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VHLP40337 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VHLP40337 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VHLP40337 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VHLP40337 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VHLP40337 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VHLP40337 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VHLP40337 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VHLP40337 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VHLP40337 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VHLP40337 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VHLP40337 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VHLP40337 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VHLP40337 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VHLP40337 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VHLP40337 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VHLP40337 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VHLP40337 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VHLP40337 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VHLP40337 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VHLP40337 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VHLP40337 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VHLP40337 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VHLP40337 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms