Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX11P35716 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX11P35716 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX11P35716 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX11P35716 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX11P35716 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX11P35716 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX11P35716 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX11P35716 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SOX11P35716 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX11P35716 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SOX11P35716 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX11P35716 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX11P35716 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX11P35716 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX11P35716 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX11P35716 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX11P35716 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX11P35716 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SOX11P35716 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SOX11P35716 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX11P35716 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX11P35716 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX11P35716 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX11P35716 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX11P35716 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX11P35716 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX11P35716 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX11P35716 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX11P35716 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX11P35716 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX11P35716 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX11P35716 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX11P35716 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX11P35716 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX11P35716 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX11P35716 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX11P35716 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX11P35716 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX11P35716 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX11P35716 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX11P35716 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX11P35716 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX11P35716 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX11P35716 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX11P35716 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SOX11P35716 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SOX11P35716 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX11P35716 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX11P35716 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX11P35716 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX11P35716 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX11P35716 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX11P35716 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX11P35716 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX11P35716 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX11P35716 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX11P35716 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX11P35716 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX11P35716 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX11P35716 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX11P35716 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX11P35716 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX11P35716 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX11P35716 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX11P35716 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SOX11P35716 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SOX11P35716 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX11P35716 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX11P35716 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX11P35716 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX11P35716 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX11P35716 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX11P35716 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX11P35716 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX11P35716 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX11P35716 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX11P35716 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX11P35716 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX11P35716 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX11P35716 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX11P35716 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX11P35716 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX11P35716 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX11P35716 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX11P35716 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX11P35716 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX11P35716 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX11P35716 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX11P35716 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX11P35716 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX11P35716 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX11P35716 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX11P35716 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX11P35716 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX11P35716 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX11P35716 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX11P35716 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX11P35716 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX11P35716 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 240.6 ms