Protein–RNA interactions for Protein: P32314

FOXN2, Forkhead box protein N2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN2P32314 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXN2P32314 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXN2P32314 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXN2P32314 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXN2P32314 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXN2P32314 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXN2P32314 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXN2P32314 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXN2P32314 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXN2P32314 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXN2P32314 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXN2P32314 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXN2P32314 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXN2P32314 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXN2P32314 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXN2P32314 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXN2P32314 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXN2P32314 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXN2P32314 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXN2P32314 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXN2P32314 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXN2P32314 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXN2P32314 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXN2P32314 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXN2P32314 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXN2P32314 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXN2P32314 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXN2P32314 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXN2P32314 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXN2P32314 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXN2P32314 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXN2P32314 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXN2P32314 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXN2P32314 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXN2P32314 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXN2P32314 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXN2P32314 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXN2P32314 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXN2P32314 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXN2P32314 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXN2P32314 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXN2P32314 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXN2P32314 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FOXN2P32314 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FOXN2P32314 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXN2P32314 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXN2P32314 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXN2P32314 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXN2P32314 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXN2P32314 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXN2P32314 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXN2P32314 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXN2P32314 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXN2P32314 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXN2P32314 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXN2P32314 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXN2P32314 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXN2P32314 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXN2P32314 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXN2P32314 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXN2P32314 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXN2P32314 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
FOXN2P32314 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXN2P32314 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXN2P32314 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXN2P32314 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXN2P32314 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXN2P32314 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXN2P32314 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXN2P32314 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms