Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TM4SF1P30408 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TM4SF1P30408 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TM4SF1P30408 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TM4SF1P30408 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TM4SF1P30408 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TM4SF1P30408 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
TM4SF1P30408 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TM4SF1P30408 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TM4SF1P30408 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TM4SF1P30408 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TM4SF1P30408 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TM4SF1P30408 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TM4SF1P30408 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TM4SF1P30408 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TM4SF1P30408 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TM4SF1P30408 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TM4SF1P30408 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TM4SF1P30408 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TM4SF1P30408 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TM4SF1P30408 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TM4SF1P30408 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TM4SF1P30408 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TM4SF1P30408 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TM4SF1P30408 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TM4SF1P30408 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TM4SF1P30408 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TM4SF1P30408 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TM4SF1P30408 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TM4SF1P30408 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TM4SF1P30408 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TM4SF1P30408 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TM4SF1P30408 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TM4SF1P30408 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TM4SF1P30408 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TM4SF1P30408 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TM4SF1P30408 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TM4SF1P30408 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TM4SF1P30408 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TM4SF1P30408 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TM4SF1P30408 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TM4SF1P30408 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TM4SF1P30408 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TM4SF1P30408 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TM4SF1P30408 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TM4SF1P30408 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
TM4SF1P30408 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
TM4SF1P30408 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TM4SF1P30408 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TM4SF1P30408 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TM4SF1P30408 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
TM4SF1P30408 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TM4SF1P30408 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TM4SF1P30408 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TM4SF1P30408 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TM4SF1P30408 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TM4SF1P30408 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TM4SF1P30408 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TM4SF1P30408 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TM4SF1P30408 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TM4SF1P30408 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TM4SF1P30408 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TM4SF1P30408 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TM4SF1P30408 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TM4SF1P30408 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TM4SF1P30408 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TM4SF1P30408 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
TM4SF1P30408 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TM4SF1P30408 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TM4SF1P30408 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
TM4SF1P30408 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TM4SF1P30408 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TM4SF1P30408 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TM4SF1P30408 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TM4SF1P30408 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TM4SF1P30408 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TM4SF1P30408 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TM4SF1P30408 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TM4SF1P30408 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TM4SF1P30408 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TM4SF1P30408 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TM4SF1P30408 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
TM4SF1P30408 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TM4SF1P30408 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TM4SF1P30408 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TM4SF1P30408 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TM4SF1P30408 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TM4SF1P30408 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TM4SF1P30408 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TM4SF1P30408 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TM4SF1P30408 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TM4SF1P30408 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TM4SF1P30408 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TM4SF1P30408 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TM4SF1P30408 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TM4SF1P30408 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TM4SF1P30408 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TM4SF1P30408 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TM4SF1P30408 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TM4SF1P30408 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms