Protein–RNA interactions for Protein: P27708

CAD, CAD protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADP27708 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CADP27708 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CADP27708 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CADP27708 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CADP27708 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CADP27708 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CADP27708 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CADP27708 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CADP27708 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CADP27708 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CADP27708 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CADP27708 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CADP27708 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CADP27708 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CADP27708 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CADP27708 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CADP27708 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CADP27708 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CADP27708 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CADP27708 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CADP27708 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CADP27708 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CADP27708 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CADP27708 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CADP27708 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CADP27708 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CADP27708 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CADP27708 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CADP27708 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CADP27708 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CADP27708 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CADP27708 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CADP27708 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CADP27708 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CADP27708 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CADP27708 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CADP27708 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CADP27708 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADP27708 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADP27708 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADP27708 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADP27708 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CADP27708 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CADP27708 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CADP27708 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CADP27708 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CADP27708 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CADP27708 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CADP27708 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CADP27708 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CADP27708 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CADP27708 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CADP27708 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CADP27708 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CADP27708 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CADP27708 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CADP27708 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CADP27708 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CADP27708 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CADP27708 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CADP27708 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CADP27708 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CADP27708 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CADP27708 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CADP27708 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CADP27708 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CADP27708 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CADP27708 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CADP27708 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CADP27708 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CADP27708 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CADP27708 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CADP27708 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CADP27708 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CADP27708 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CADP27708 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CADP27708 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CADP27708 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CADP27708 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CADP27708 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CADP27708 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CADP27708 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CADP27708 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CADP27708 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CADP27708 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CADP27708 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CADP27708 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CADP27708 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CADP27708 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CADP27708 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CADP27708 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CADP27708 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CADP27708 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CADP27708 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CADP27708 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CADP27708 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CADP27708 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CADP27708 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CADP27708 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CADP27708 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms