Protein–RNA interactions for Protein: P26367

PAX6, Paired box protein Pax-6, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX6P26367 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAX6P26367 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAX6P26367 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAX6P26367 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAX6P26367 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAX6P26367 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAX6P26367 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAX6P26367 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAX6P26367 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAX6P26367 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX6P26367 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX6P26367 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX6P26367 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX6P26367 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAX6P26367 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAX6P26367 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAX6P26367 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAX6P26367 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAX6P26367 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAX6P26367 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAX6P26367 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAX6P26367 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAX6P26367 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAX6P26367 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX6P26367 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX6P26367 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX6P26367 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX6P26367 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX6P26367 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX6P26367 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX6P26367 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX6P26367 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX6P26367 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX6P26367 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX6P26367 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX6P26367 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX6P26367 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX6P26367 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX6P26367 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX6P26367 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX6P26367 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX6P26367 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX6P26367 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX6P26367 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX6P26367 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX6P26367 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX6P26367 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX6P26367 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX6P26367 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX6P26367 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX6P26367 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX6P26367 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX6P26367 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX6P26367 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX6P26367 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX6P26367 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX6P26367 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX6P26367 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX6P26367 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX6P26367 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX6P26367 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX6P26367 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX6P26367 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX6P26367 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX6P26367 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX6P26367 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX6P26367 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX6P26367 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX6P26367 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX6P26367 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAX6P26367 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX6P26367 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX6P26367 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX6P26367 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX6P26367 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX6P26367 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX6P26367 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX6P26367 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX6P26367 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX6P26367 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX6P26367 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX6P26367 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX6P26367 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX6P26367 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX6P26367 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX6P26367 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX6P26367 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX6P26367 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX6P26367 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX6P26367 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX6P26367 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX6P26367 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX6P26367 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX6P26367 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX6P26367 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX6P26367 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX6P26367 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PAX6P26367 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAX6P26367 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAX6P26367 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms