Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNA5P22460 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNA5P22460 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNA5P22460 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNA5P22460 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNA5P22460 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNA5P22460 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNA5P22460 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNA5P22460 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNA5P22460 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNA5P22460 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNA5P22460 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNA5P22460 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNA5P22460 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNA5P22460 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNA5P22460 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNA5P22460 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNA5P22460 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNA5P22460 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNA5P22460 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNA5P22460 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNA5P22460 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNA5P22460 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNA5P22460 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNA5P22460 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
KCNA5P22460 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
KCNA5P22460 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNA5P22460 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNA5P22460 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNA5P22460 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNA5P22460 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNA5P22460 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNA5P22460 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNA5P22460 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNA5P22460 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNA5P22460 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNA5P22460 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNA5P22460 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNA5P22460 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNA5P22460 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNA5P22460 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNA5P22460 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KCNA5P22460 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KCNA5P22460 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNA5P22460 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNA5P22460 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNA5P22460 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNA5P22460 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNA5P22460 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNA5P22460 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNA5P22460 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNA5P22460 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNA5P22460 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNA5P22460 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNA5P22460 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNA5P22460 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNA5P22460 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNA5P22460 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNA5P22460 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNA5P22460 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNA5P22460 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNA5P22460 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNA5P22460 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNA5P22460 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNA5P22460 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNA5P22460 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNA5P22460 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNA5P22460 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNA5P22460 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNA5P22460 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNA5P22460 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNA5P22460 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNA5P22460 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNA5P22460 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNA5P22460 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNA5P22460 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNA5P22460 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNA5P22460 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNA5P22460 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNA5P22460 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNA5P22460 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNA5P22460 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNA5P22460 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNA5P22460 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNA5P22460 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KCNA5P22460 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KCNA5P22460 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNA5P22460 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNA5P22460 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KCNA5P22460 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KCNA5P22460 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNA5P22460 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNA5P22460 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNA5P22460 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNA5P22460 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNA5P22460 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNA5P22460 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNA5P22460 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNA5P22460 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNA5P22460 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms