Protein–RNA interactions for Protein: P20336

RAB3A, Ras-related protein Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3AP20336 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3AP20336 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3AP20336 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3AP20336 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3AP20336 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3AP20336 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3AP20336 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3AP20336 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3AP20336 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3AP20336 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3AP20336 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3AP20336 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3AP20336 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3AP20336 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3AP20336 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3AP20336 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3AP20336 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3AP20336 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3AP20336 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3AP20336 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB3AP20336 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB3AP20336 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3AP20336 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3AP20336 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3AP20336 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3AP20336 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3AP20336 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3AP20336 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3AP20336 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3AP20336 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3AP20336 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3AP20336 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3AP20336 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3AP20336 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3AP20336 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3AP20336 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3AP20336 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3AP20336 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3AP20336 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3AP20336 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3AP20336 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3AP20336 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3AP20336 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3AP20336 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3AP20336 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3AP20336 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms