Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDCP19113 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDCP19113 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDCP19113 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDCP19113 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HDCP19113 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HDCP19113 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HDCP19113 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HDCP19113 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HDCP19113 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HDCP19113 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HDCP19113 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HDCP19113 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HDCP19113 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HDCP19113 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDCP19113 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDCP19113 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDCP19113 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDCP19113 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDCP19113 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDCP19113 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDCP19113 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDCP19113 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDCP19113 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDCP19113 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDCP19113 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDCP19113 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDCP19113 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDCP19113 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HDCP19113 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDCP19113 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDCP19113 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HDCP19113 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDCP19113 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HDCP19113 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDCP19113 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDCP19113 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDCP19113 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDCP19113 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDCP19113 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDCP19113 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDCP19113 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDCP19113 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDCP19113 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDCP19113 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDCP19113 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDCP19113 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDCP19113 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDCP19113 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDCP19113 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDCP19113 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDCP19113 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDCP19113 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HDCP19113 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDCP19113 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDCP19113 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDCP19113 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDCP19113 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDCP19113 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDCP19113 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDCP19113 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDCP19113 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDCP19113 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDCP19113 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDCP19113 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDCP19113 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDCP19113 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HDCP19113 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDCP19113 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDCP19113 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDCP19113 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDCP19113 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDCP19113 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDCP19113 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDCP19113 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDCP19113 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDCP19113 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDCP19113 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDCP19113 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDCP19113 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDCP19113 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HDCP19113 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HDCP19113 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDCP19113 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDCP19113 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDCP19113 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDCP19113 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDCP19113 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HDCP19113 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDCP19113 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDCP19113 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HDCP19113 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HDCP19113 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDCP19113 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDCP19113 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDCP19113 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HDCP19113 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDCP19113 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDCP19113 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HDCP19113 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms