Protein–RNA interactions for Protein: P17040

ZSCAN20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN20P17040 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZSCAN20P17040 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZSCAN20P17040 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZSCAN20P17040 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZSCAN20P17040 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZSCAN20P17040 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZSCAN20P17040 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZSCAN20P17040 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZSCAN20P17040 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZSCAN20P17040 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZSCAN20P17040 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZSCAN20P17040 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZSCAN20P17040 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZSCAN20P17040 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZSCAN20P17040 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZSCAN20P17040 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZSCAN20P17040 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZSCAN20P17040 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZSCAN20P17040 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZSCAN20P17040 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZSCAN20P17040 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZSCAN20P17040 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZSCAN20P17040 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZSCAN20P17040 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZSCAN20P17040 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZSCAN20P17040 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZSCAN20P17040 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZSCAN20P17040 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZSCAN20P17040 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZSCAN20P17040 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZSCAN20P17040 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZSCAN20P17040 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZSCAN20P17040 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZSCAN20P17040 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZSCAN20P17040 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZSCAN20P17040 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZSCAN20P17040 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZSCAN20P17040 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZSCAN20P17040 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZSCAN20P17040 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZSCAN20P17040 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZSCAN20P17040 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZSCAN20P17040 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZSCAN20P17040 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZSCAN20P17040 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZSCAN20P17040 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZSCAN20P17040 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZSCAN20P17040 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZSCAN20P17040 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZSCAN20P17040 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZSCAN20P17040 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZSCAN20P17040 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZSCAN20P17040 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZSCAN20P17040 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZSCAN20P17040 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZSCAN20P17040 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZSCAN20P17040 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZSCAN20P17040 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZSCAN20P17040 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZSCAN20P17040 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZSCAN20P17040 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZSCAN20P17040 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZSCAN20P17040 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZSCAN20P17040 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZSCAN20P17040 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZSCAN20P17040 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZSCAN20P17040 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZSCAN20P17040 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZSCAN20P17040 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZSCAN20P17040 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZSCAN20P17040 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZSCAN20P17040 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms