Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGA4P13612 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGA4P13612 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGA4P13612 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGA4P13612 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGA4P13612 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGA4P13612 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGA4P13612 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGA4P13612 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGA4P13612 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGA4P13612 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGA4P13612 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ITGA4P13612 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGA4P13612 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGA4P13612 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGA4P13612 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGA4P13612 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGA4P13612 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGA4P13612 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGA4P13612 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGA4P13612 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGA4P13612 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGA4P13612 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGA4P13612 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGA4P13612 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGA4P13612 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGA4P13612 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGA4P13612 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGA4P13612 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGA4P13612 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ITGA4P13612 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGA4P13612 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGA4P13612 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGA4P13612 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGA4P13612 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGA4P13612 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGA4P13612 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGA4P13612 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGA4P13612 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGA4P13612 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGA4P13612 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGA4P13612 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGA4P13612 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGA4P13612 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGA4P13612 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGA4P13612 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGA4P13612 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGA4P13612 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGA4P13612 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGA4P13612 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGA4P13612 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGA4P13612 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGA4P13612 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGA4P13612 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGA4P13612 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGA4P13612 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGA4P13612 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGA4P13612 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGA4P13612 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA4P13612 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA4P13612 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA4P13612 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA4P13612 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA4P13612 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGA4P13612 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGA4P13612 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGA4P13612 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ITGA4P13612 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms