Protein–RNA interactions for Protein: P0C0E4

RAB40AL, Ras-related protein Rab-40A-like, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40ALP0C0E4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB40ALP0C0E4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB40ALP0C0E4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB40ALP0C0E4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB40ALP0C0E4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB40ALP0C0E4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB40ALP0C0E4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB40ALP0C0E4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB40ALP0C0E4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB40ALP0C0E4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB40ALP0C0E4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB40ALP0C0E4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB40ALP0C0E4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB40ALP0C0E4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB40ALP0C0E4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB40ALP0C0E4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB40ALP0C0E4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB40ALP0C0E4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB40ALP0C0E4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB40ALP0C0E4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB40ALP0C0E4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB40ALP0C0E4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB40ALP0C0E4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB40ALP0C0E4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB40ALP0C0E4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB40ALP0C0E4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB40ALP0C0E4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB40ALP0C0E4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB40ALP0C0E4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB40ALP0C0E4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB40ALP0C0E4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB40ALP0C0E4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB40ALP0C0E4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB40ALP0C0E4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB40ALP0C0E4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB40ALP0C0E4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB40ALP0C0E4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB40ALP0C0E4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB40ALP0C0E4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB40ALP0C0E4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB40ALP0C0E4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB40ALP0C0E4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB40ALP0C0E4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB40ALP0C0E4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB40ALP0C0E4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB40ALP0C0E4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB40ALP0C0E4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB40ALP0C0E4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB40ALP0C0E4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB40ALP0C0E4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB40ALP0C0E4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB40ALP0C0E4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB40ALP0C0E4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB40ALP0C0E4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB40ALP0C0E4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB40ALP0C0E4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB40ALP0C0E4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB40ALP0C0E4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB40ALP0C0E4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB40ALP0C0E4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB40ALP0C0E4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB40ALP0C0E4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB40ALP0C0E4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB40ALP0C0E4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB40ALP0C0E4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB40ALP0C0E4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB40ALP0C0E4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB40ALP0C0E4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB40ALP0C0E4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB40ALP0C0E4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB40ALP0C0E4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB40ALP0C0E4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB40ALP0C0E4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms