Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT7P08729 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT7P08729 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT7P08729 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT7P08729 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT7P08729 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT7P08729 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KRT7P08729 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT7P08729 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT7P08729 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT7P08729 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT7P08729 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT7P08729 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT7P08729 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT7P08729 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT7P08729 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT7P08729 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT7P08729 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT7P08729 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT7P08729 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT7P08729 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT7P08729 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT7P08729 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT7P08729 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT7P08729 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT7P08729 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT7P08729 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT7P08729 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT7P08729 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRT7P08729 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT7P08729 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT7P08729 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT7P08729 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT7P08729 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT7P08729 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT7P08729 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT7P08729 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT7P08729 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT7P08729 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT7P08729 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT7P08729 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT7P08729 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT7P08729 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT7P08729 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT7P08729 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT7P08729 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT7P08729 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT7P08729 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT7P08729 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT7P08729 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT7P08729 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT7P08729 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT7P08729 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT7P08729 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT7P08729 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT7P08729 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT7P08729 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT7P08729 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT7P08729 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT7P08729 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT7P08729 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT7P08729 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT7P08729 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT7P08729 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT7P08729 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT7P08729 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT7P08729 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT7P08729 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT7P08729 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT7P08729 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT7P08729 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT7P08729 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT7P08729 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT7P08729 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT7P08729 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT7P08729 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT7P08729 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT7P08729 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT7P08729 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT7P08729 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT7P08729 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT7P08729 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT7P08729 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT7P08729 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT7P08729 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT7P08729 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT7P08729 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT7P08729 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT7P08729 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT7P08729 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT7P08729 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT7P08729 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT7P08729 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KRT7P08729 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT7P08729 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT7P08729 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT7P08729 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT7P08729 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT7P08729 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT7P08729 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms