Protein–RNA interactions for Protein: P06730

EIF4E, Eukaryotic translation initiation factor 4E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EP06730 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4EP06730 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF4EP06730 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4EP06730 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4EP06730 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF4EP06730 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4EP06730 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4EP06730 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4EP06730 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4EP06730 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4EP06730 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF4EP06730 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4EP06730 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4EP06730 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF4EP06730 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4EP06730 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4EP06730 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4EP06730 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4EP06730 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF4EP06730 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF4EP06730 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4EP06730 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF4EP06730 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4EP06730 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4EP06730 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4EP06730 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4EP06730 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4EP06730 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4EP06730 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4EP06730 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4EP06730 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF4EP06730 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4EP06730 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4EP06730 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4EP06730 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF4EP06730 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4EP06730 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4EP06730 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4EP06730 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4EP06730 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4EP06730 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4EP06730 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF4EP06730 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF4EP06730 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms