Protein–RNA interactions for Protein: P06312

IGKV4-1, Immunoglobulin kappa variable 4-1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV4-1P06312 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IGKV4-1P06312 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGKV4-1P06312 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV4-1P06312 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms