Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSF2P04141 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSF2P04141 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSF2P04141 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSF2P04141 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSF2P04141 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSF2P04141 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSF2P04141 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSF2P04141 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSF2P04141 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSF2P04141 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSF2P04141 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF2P04141 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF2P04141 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF2P04141 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF2P04141 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSF2P04141 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSF2P04141 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSF2P04141 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSF2P04141 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSF2P04141 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSF2P04141 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSF2P04141 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSF2P04141 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSF2P04141 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF2P04141 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF2P04141 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF2P04141 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF2P04141 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF2P04141 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF2P04141 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF2P04141 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF2P04141 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF2P04141 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSF2P04141 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSF2P04141 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CSF2P04141 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF2P04141 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF2P04141 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF2P04141 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSF2P04141 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSF2P04141 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSF2P04141 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSF2P04141 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSF2P04141 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSF2P04141 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSF2P04141 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSF2P04141 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSF2P04141 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSF2P04141 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CSF2P04141 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSF2P04141 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF2P04141 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF2P04141 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF2P04141 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF2P04141 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF2P04141 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSF2P04141 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSF2P04141 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSF2P04141 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF2P04141 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF2P04141 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF2P04141 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF2P04141 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF2P04141 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF2P04141 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSF2P04141 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSF2P04141 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSF2P04141 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF2P04141 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF2P04141 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF2P04141 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF2P04141 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF2P04141 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF2P04141 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF2P04141 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF2P04141 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF2P04141 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF2P04141 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF2P04141 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF2P04141 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF2P04141 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF2P04141 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF2P04141 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF2P04141 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF2P04141 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF2P04141 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF2P04141 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSF2P04141 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSF2P04141 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSF2P04141 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSF2P04141 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF2P04141 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF2P04141 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF2P04141 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF2P04141 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF2P04141 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CSF2P04141 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF2P04141 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSF2P04141 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms