Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C9P02748 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C9P02748 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C9P02748 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C9P02748 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C9P02748 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C9P02748 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C9P02748 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C9P02748 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C9P02748 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C9P02748 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C9P02748 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9P02748 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9P02748 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9P02748 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C9P02748 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
C9P02748 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
C9P02748 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
C9P02748 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C9P02748 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9P02748 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
C9P02748 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9P02748 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9P02748 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C9P02748 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9P02748 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9P02748 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9P02748 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C9P02748 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C9P02748 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9P02748 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9P02748 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9P02748 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C9P02748 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9P02748 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9P02748 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9P02748 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C9P02748 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9P02748 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9P02748 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9P02748 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9P02748 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9P02748 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9P02748 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9P02748 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9P02748 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9P02748 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C9P02748 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9P02748 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9P02748 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9P02748 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9P02748 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C9P02748 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9P02748 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9P02748 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9P02748 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C9P02748 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9P02748 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9P02748 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
C9P02748 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9P02748 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9P02748 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C9P02748 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9P02748 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9P02748 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9P02748 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9P02748 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9P02748 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9P02748 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9P02748 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C9P02748 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C9P02748 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C9P02748 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C9P02748 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C9P02748 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C9P02748 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C9P02748 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C9P02748 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C9P02748 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C9P02748 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C9P02748 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9P02748 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9P02748 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9P02748 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9P02748 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9P02748 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C9P02748 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9P02748 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9P02748 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9P02748 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9P02748 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C9P02748 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9P02748 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9P02748 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9P02748 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9P02748 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9P02748 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9P02748 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9P02748 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9P02748 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.2 ms