Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMNAP02545 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMNAP02545 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMNAP02545 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMNAP02545 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LMNAP02545 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LMNAP02545 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LMNAP02545 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LMNAP02545 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LMNAP02545 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LMNAP02545 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LMNAP02545 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LMNAP02545 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LMNAP02545 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMNAP02545 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMNAP02545 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMNAP02545 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMNAP02545 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMNAP02545 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMNAP02545 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMNAP02545 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMNAP02545 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMNAP02545 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMNAP02545 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMNAP02545 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMNAP02545 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMNAP02545 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMNAP02545 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMNAP02545 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMNAP02545 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMNAP02545 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMNAP02545 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMNAP02545 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMNAP02545 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMNAP02545 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMNAP02545 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LMNAP02545 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LMNAP02545 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMNAP02545 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMNAP02545 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMNAP02545 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMNAP02545 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMNAP02545 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMNAP02545 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMNAP02545 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMNAP02545 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMNAP02545 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMNAP02545 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMNAP02545 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LMNAP02545 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMNAP02545 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMNAP02545 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMNAP02545 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMNAP02545 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMNAP02545 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMNAP02545 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMNAP02545 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMNAP02545 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMNAP02545 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMNAP02545 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMNAP02545 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMNAP02545 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMNAP02545 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMNAP02545 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMNAP02545 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMNAP02545 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMNAP02545 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMNAP02545 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMNAP02545 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMNAP02545 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LMNAP02545 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMNAP02545 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMNAP02545 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMNAP02545 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMNAP02545 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMNAP02545 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMNAP02545 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMNAP02545 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMNAP02545 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMNAP02545 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMNAP02545 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMNAP02545 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMNAP02545 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMNAP02545 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LMNAP02545 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNAP02545 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNAP02545 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMNAP02545 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMNAP02545 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMNAP02545 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMNAP02545 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMNAP02545 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMNAP02545 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMNAP02545 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMNAP02545 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMNAP02545 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMNAP02545 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMNAP02545 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMNAP02545 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMNAP02545 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms