Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
EGFRP00533 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
EGFRP00533 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
EGFRP00533 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
EGFRP00533 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
EGFRP00533 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
EGFRP00533 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
EGFRP00533 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
EGFRP00533 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
EGFRP00533 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
EGFRP00533 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
EGFRP00533 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
EGFRP00533 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
EGFRP00533 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
EGFRP00533 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
EGFRP00533 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
EGFRP00533 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
EGFRP00533 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
EGFRP00533 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
EGFRP00533 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
EGFRP00533 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
EGFRP00533 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
EGFRP00533 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
EGFRP00533 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
EGFRP00533 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
EGFRP00533 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
EGFRP00533 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
EGFRP00533 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
EGFRP00533 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
EGFRP00533 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
EGFRP00533 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
EGFRP00533 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
EGFRP00533 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
EGFRP00533 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
EGFRP00533 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
EGFRP00533 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
EGFRP00533 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
EGFRP00533 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
EGFRP00533 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
EGFRP00533 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
EGFRP00533 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
EGFRP00533 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
EGFRP00533 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
EGFRP00533 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
EGFRP00533 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
EGFRP00533 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
EGFRP00533 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
EGFRP00533 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
EGFRP00533 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
EGFRP00533 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
EGFRP00533 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
EGFRP00533 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
EGFRP00533 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
EGFRP00533 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
EGFRP00533 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
EGFRP00533 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
EGFRP00533 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
EGFRP00533 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
EGFRP00533 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
EGFRP00533 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
EGFRP00533 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
EGFRP00533 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
EGFRP00533 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
EGFRP00533 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
EGFRP00533 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
EGFRP00533 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
EGFRP00533 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
EGFRP00533 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
EGFRP00533 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
EGFRP00533 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
EGFRP00533 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
EGFRP00533 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
EGFRP00533 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
EGFRP00533 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
EGFRP00533 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
EGFRP00533 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
EGFRP00533 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
EGFRP00533 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
EGFRP00533 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
EGFRP00533 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
EGFRP00533 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
EGFRP00533 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
EGFRP00533 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
EGFRP00533 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
EGFRP00533 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
EGFRP00533 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
EGFRP00533 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
EGFRP00533 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
EGFRP00533 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
EGFRP00533 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
EGFRP00533 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
EGFRP00533 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
EGFRP00533 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
EGFRP00533 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
EGFRP00533 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
EGFRP00533 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
EGFRP00533 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
EGFRP00533 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
EGFRP00533 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
EGFRP00533 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.1 ms