Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOP3BO95985 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TOP3BO95985 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TOP3BO95985 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TOP3BO95985 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOP3BO95985 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOP3BO95985 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOP3BO95985 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOP3BO95985 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP3BO95985 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP3BO95985 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP3BO95985 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOP3BO95985 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP3BO95985 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP3BO95985 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOP3BO95985 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP3BO95985 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP3BO95985 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP3BO95985 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP3BO95985 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP3BO95985 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP3BO95985 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP3BO95985 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TOP3BO95985 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TOP3BO95985 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOP3BO95985 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOP3BO95985 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOP3BO95985 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOP3BO95985 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOP3BO95985 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOP3BO95985 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOP3BO95985 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOP3BO95985 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOP3BO95985 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOP3BO95985 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOP3BO95985 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOP3BO95985 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOP3BO95985 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOP3BO95985 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOP3BO95985 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOP3BO95985 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TOP3BO95985 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TOP3BO95985 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TOP3BO95985 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms