Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNGR4O95473 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNGR4O95473 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNGR4O95473 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNGR4O95473 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNGR4O95473 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNGR4O95473 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNGR4O95473 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNGR4O95473 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNGR4O95473 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNGR4O95473 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNGR4O95473 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNGR4O95473 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNGR4O95473 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNGR4O95473 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGR4O95473 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGR4O95473 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGR4O95473 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGR4O95473 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGR4O95473 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNGR4O95473 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNGR4O95473 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNGR4O95473 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNGR4O95473 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNGR4O95473 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNGR4O95473 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNGR4O95473 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNGR4O95473 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNGR4O95473 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNGR4O95473 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNGR4O95473 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNGR4O95473 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNGR4O95473 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNGR4O95473 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGR4O95473 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGR4O95473 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNGR4O95473 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNGR4O95473 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNGR4O95473 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNGR4O95473 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNGR4O95473 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNGR4O95473 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNGR4O95473 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNGR4O95473 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNGR4O95473 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNGR4O95473 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNGR4O95473 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNGR4O95473 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNGR4O95473 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNGR4O95473 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNGR4O95473 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNGR4O95473 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNGR4O95473 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNGR4O95473 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNGR4O95473 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNGR4O95473 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGR4O95473 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGR4O95473 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGR4O95473 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGR4O95473 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGR4O95473 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNGR4O95473 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNGR4O95473 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNGR4O95473 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYNGR4O95473 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNGR4O95473 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168 ms